| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,524,184 | C→T | A438A (GCC→GCT) | mrcA → | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,524,184 | 0 | C | T | 98.6% | 264.5 / NA | 73 | A438A (GCC→GCT) | mrcA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (34/38); minor base G (0/1); total (34/39) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCTGCCAACCTATGGTCCGCTGCTGCCTGCCGCAGTCACCAGCGCCAATCCTCAGCAAGCGACGGCGATGCTGGCGGACGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGGGCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGAT > NC_000913/3523894‑3524477 | gcgcTGCCAACCTATGGTCCGCTGCTGCCTGCCGCAGTCACCAGCGCCAATCCTCAGCAAGCGACGGCGATGCTGGCGGACGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGGGCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTGTGTCAGGTTGGCGGTGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGTAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCGGTTATGgcg < 2:355000/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |