| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,014,151 | IS2 (–) +5 bp | coding (893‑897/1641 nt) | pqiB → | intermembrane transport protein PqiB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1014155 | 0 (0.000) | 89 (0.960) | 60/590 | 0.2 | 100% | coding (897/1641 nt) | pqiB | intermembrane transport protein PqiB |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
ATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGTGTT > NC_000913/1467616‑1468206 | aTGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGAtt < 1:552133/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |