| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,768,435 | 0 | C | A | 28.3% | 377.9 / 15.5 | 194 | Q87K (CAG→AAG) | yibG | tetratricopeptide‑like domain‑containing protein YibG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/92); new base A (55/0); total (102/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-20 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
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gATCAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAATGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTAAAAAAGCTAAAGCGAACGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCCGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCgc > 2:305115/1‑300 (MQ=255) cAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGCTGAATCAGGGCTGTATTATAACTATTCTTGGTAACATTAACCgcagc > 2:357902/1‑300 (MQ=255) tctcAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCGCAGCAgggg < 1:661680/300‑1 (MQ=255) | CGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGATTTAAGTGAAGAAAAGTTGATGAAACTGAAGTATAAATCACAACATGGTGATTCAGAGGCATCATTTCGACTATATCAATATTACTGCTTTACTAAAAATAACATTTACAAACAATTGCGATTCTTGGAAAGATCAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCGCAGCAGGGG > NC_000913/3768137‑3768731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |