| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2904225 | 92 (0.850) | 7 (0.070) | 6/530 | 7.4 | 6.5% | intergenic (+851/+522) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
| ? | NC_000913 | 2904409 = | 119 (1.220) | intergenic (+1035/+338) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTG > NC_000913/2903926‑2904520 | tttGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTCATTACAAGTACGGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACt < 1:11515/300‑1 (MQ=255)ttggAACAGGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACt < 1:11196/297‑1 (MQ=255) tGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTgg < 1:799787/300‑1 (MQ=255) gAACATTAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTNTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGc < 2:260052/300‑1 (MQ=255) 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tGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAc < 1:158580/300‑1 (MQ=255) tGTTGCTTACTACACGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGNGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAc < 1:640145/300‑1 (MQ=255) tGTTGCTTACTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGNGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAc < 1:640200/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |