| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2357730 | 127 (1.170) | 8 (0.090) | 8/510 | 6.4 | 7.7% | coding (827/900 nt) | rpnE | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE |
| ? | NC_000913 | 2357926 = | 82 (0.880) | intergenic (+123/+116) | rpnE/yfaU | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE/2‑keto‑3‑deoxy‑L‑rhamnonate aldolase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGCGAATAACCACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGATCCC > NC_000913/2357433‑2358026 | aaCTGATTCAAAAGCATNTTCGCGACCGCGATTTAANCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCNTTGCGCATGCTGGAGc < 1:734052/300‑1 (MQ=255)aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCACGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 1:311913/300‑1 (MQ=255)aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTNCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAGTTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 1:631535/300‑1 (MQ=255) tGATTCAAAAGCGTATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAg < 1:284058/299‑1 (MQ=255) aTTCAAAGGCATATTCGGGACCGCGATTGAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTGGGTGAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCGGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CGCTACAAAAGGAGAGGGTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCTTCAAATTGGCCGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGc < 2:533943/300‑1 (MQ=255) aaGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGaa < 1:342916/300‑1 (MQ=255) ggaatatTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGTTCGACAGGATCACCACACTTTTGTTTAGAGGCTTCACTAAGGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATGATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTTATGAGATTGCCGAACATTAAC‑CACTACAAAAGTATAGATTAATTACTAGTGCGGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTTGCTGGCAGGAAGGTATGCATAAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAAc < 2:16506/297‑1 (MQ=255) atTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTgag < 2:486937/300‑1 (MQ=255) aCCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGc < 1:608653/300‑1 (MQ=255) gATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTGTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCg < 1:353091/300‑1 (MQ=255) tctgtaTGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGTAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTTGCGACAAccc < 2:175378/295‑1 (MQ=255) tCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAAccc < 1:824760/300‑1 (MQ=255) gCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGCACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCa > 2:363545/1‑298 (MQ=255) gCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAAc > 1:152540/1‑300 (MQ=255) gCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTCTGGTTAGAGGCTTCACTAATAACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTACTTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAACATTTCTTTTCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCaa > 2:363004/1‑299 (MQ=255) aTGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTc < 1:229650/300‑1 (MQ=255) gTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAAccccaatcac > 1:839799/1‑292 (MQ=255) gTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACt > 2:602261/1‑300 (MQ=255) gTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACt > 1:102916/1‑300 (MQ=255) tCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTNCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTNGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTg < 2:642662/300‑1 (MQ=255) cGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTAAAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGCTTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACtaa > 1:657123/1‑298 (MQ=255) cGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCAGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGa > 1:330624/1‑300 (MQ=255) aGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCAAACTCACTGATGc < 1:810420/299‑1 (MQ=255) aGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTGCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGc < 2:37445/299‑1 (MQ=255) ggATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCt > 2:59240/1‑299 (MQ=255) gATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGa < 2:809771/294‑1 (MQ=255) aTCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCNATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGat < 1:634536/300‑1 (MQ=255) aTCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCACGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGat < 2:758833/300‑1 (MQ=255) ccacGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGCGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTAACTGCTGCTGATATTc > 2:29514/1‑300 (MQ=255) acGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTc < 1:446625/298‑1 (MQ=255) cTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCAGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGGTTGCCGAACGTTCAC‑CACTAAAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAATAGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCACACTCATTGATGCTGATATTCCGAAc > 2:31712/1‑300 (MQ=39) 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gagGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTTT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTTAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTaaa < 2:176211/300‑1 (MQ=255) gagGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTaaa < 2:330624/300‑1 (MQ=255) gaagCTTCACTAATGACATCTAGAGACAACCAC‑GTGTTAAGTATCGGCTGTAATTCTGCGATACCTCTCGTTTCGCCCGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTGCAAAAGGAGAGATTACTGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTCGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTACTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCACTaaa < 2:378148/297‑1 (MQ=37) 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tGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGCGAATAACCACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGAt > 1:104483/1‑300 (MQ=255) tGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAAATCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGTGAATAAACACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGAt > 2:847047/1‑300 (MQ=255) gCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGTAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGCGAATAACCACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGATc < 1:750583/300‑1 (MQ=255) | AACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGT‑TTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCAC‑CACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGCGAATAACCACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGATCCC > NC_000913/2357433‑2358026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |