| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696506 | 115 (1.060) | 5 (0.050) +AAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATT |
5/500 | 7.6 | 5.4% | intergenic (‑2/+36) | glnX/glnV | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 697057 = | 91 (0.840) | noncoding (77/77 nt) | metT | tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GGGTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAA > NC_000913/696208‑696799 | gggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAc < 1:150864/299‑1 (MQ=255)gggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGAAATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAAc > 1:436476/1‑299 (MQ=255) ggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGTTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTg < 1:837788/300‑1 (MQ=255) ggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTg < 1:442795/300‑1 (MQ=255) ggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAAGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCATAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTg < 2:76233/300‑1 (MQ=255) ggTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACANTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGTTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTg < 1:629691/300‑1 (MQ=255) tAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGt < 1:134424/300‑1 (MQ=255) ggcggAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTa > 1:337315/1‑300 (MQ=255) gAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACCGGGTGCAATTACaa > 1:792794/1‑299 (MQ=255) aGCGTGCTGTCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAGATATGCGTTATGTTTTTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGCTACGAGGATTCAAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCTTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAgg < 2:245765/300‑1 (MQ=255) aGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAANGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAgg < 2:610139/300‑1 (MQ=255) aGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAgg < 1:507037/300‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTaa > 1:707786/1‑300 (MQ=255) tttaaaCGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACATGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAAt < 2:321842/297‑1 (MQ=255) gcgcTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTNGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAc > 1:616541/1‑257 (MQ=255) aaaTATGCGTTAGGGTTNTAGCCTTACAACATTGCCNGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATANATTGGCTGGGGTACGa < 1:724049/300‑1 (MQ=255) aaTATGCGTTAGGGTTTTAGCCTTACAACATTGCCGGGTGCATGCCAACTGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAg < 2:254539/300‑1 (MQ=255) aaTATGCGTGAGGGTTGGAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAg < 1:117975/300‑1 (MQ=255) aaTACGCGTTAGGGTTGNAGCCTTACAACATTGCCGNATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAANTTGGCTGGGGTACGAg < 1:723980/300‑1 (MQ=255) tatGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGa < 1:93358/300‑1 (MQ=255) gggTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTAGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGTACTTACACGGTAAGCGTCTTGACTAAATTGGATGGGGTACGAGGAtgtgaa > 2:697565/1‑292 (MQ=255) gTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCTAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCt < 2:297862/298‑1 (MQ=255) gTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTATTGAATAAGTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAAc > 2:219119/1‑296 (MQ=255) gTTGTAGCCTTACAACATTGCAGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTc > 2:125954/1‑299 (MQ=255) gCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACTAGGATTCGAACCTCGGAATGc > 1:50172/1‑300 (MQ=255) 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cGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGTACTTACAAGGTCAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTa > 2:410141/1‑256 (MQ=255) cGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTATGGGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGcat > 2:411328/1‑298 (MQ=255) gccacccgtaattCGGATAAGGCGCGGCATCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAAACGTGTCAACATCGCATGCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCTAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACTCCAACTGGGGGCACGTACAAGGTAAGCGTCTTGAAGAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTAc < 2:454697/288‑1 (MQ=38) cAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCATTAcc > 1:401502/1‑299 (MQ=255) actcGTAGTTCGGATAAGACGCGGCGGCGTCGCATCCTACATTTAAGTATAAACCTTATCAACATCGCATTTGATAGTGGATGAACTCGGACAAGCAAGAAGCGCGCCTAAGCAAGCTTGTTTAAGGTGGATGGGGTATGAGGATTTGAACCGCTGAATGCCGGAATTGGGACCCGGTGCCTTATCGCTTGGCGAGACACCGAATAGGGACACTTGCAAGGGAGGCGGCTTGAATAAGGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCg < 2:598071/296‑1 (MQ=255) ccGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCtggg > 2:496194/1‑263 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |