| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 590,965 | C→T | L738L (CTG→CTA) | nfrB ← | cyclic di‑3',5'‑guanylate‑activated glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 590,965 | 0 | C | T | 98.9% | 307.6 / NA | 92 | L738L (CTG→CTA) | nfrB | cyclic di‑3',5'‑guanylate‑activated glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (50/41); minor base G (0/1); total (50/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACCAAAATGGCGATAGGCTTCCGCAAGGTATAAAGTCAGCGGAATATTATCCGGCACCTGCTGGTGTATATATTCAAATTCGCGGATGGCGGTTGCTTCGTCGTTATTTTTCTGTGCCTTCAGCGCTTTATCGAGACGGGGATAAATAACAAAATGGCGATAATCGCTCAGCCCCAGCTCTTCTG‑CGCTGGTGCCGATATTGT‑CTGCGAGTGCGCTGGTACTCAATAAAGACGTCAGCAGTAAACCAGACCATCCGATGACGCGATTAAGGTTATTCTCCTTCATTTTCGGACTCCAGTTGCGCAACCTGTTCTGTGTTTAAACCTGCTTTGAGTAATAGTGATTGCATCGAAACTTGTAATTCGCGTTGAATTGTCAGGACGCGATCCAACGTTTCCTGGCTGATAACGCCTTCGGTGACCAAAAACTTGCCGAGCGGCAGAGAACTGCGTTCATGGCGCAATAACAACACGTTAATTGCTGAACGATTAATATGACCGAGCGTGGTCAGTATTTCGGCGAACAGGAACTGATGCGGCACATATTGCCGCCAGATTTCACCGGCCTGCTGTTCCGTGAGCCACTGATGC > NC_000913/590669‑591259 | gACCAAAATGGCGATAGGCTTCCGCAAGGTATAAAGTCAGCGGAATATTATCCTGCACCTGCTGGTGTATATATTCAAATTCGCGGATGGCGGTTGCTTCGTCGTTATTTTTCTGTGCCTTCAGCGCTTTATCGAGACGGGGATAAATAACAAAATGGCGATAATCGCTAAGCCCCAGCTCTTCTG‑CGCTGGTGCCGATATTGT‑CTGCGAGTGCGCTGGTACTCAATAAAGACGTCAGCAGTAAACCAGACCATCCGATGACGCGATTAAGGTTATTCTCCTTCATTTTCGGACTCTAGt < 1:215406/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |