| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 181,564 | C→T | T227T (ACC→ACT) | degP → | periplasmic serine endoprotease DegP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 181,564 | 0 | C | T | 99.1% | 401.1 / NA | 116 | T227T (ACC→ACT) | degP | periplasmic serine endoprotease DegP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (53/62); minor base G (0/1); total (53/63) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGATTCTGATGCACTGCGCGTGGGTGATTACACCGTAGCGATTGGTAACCCGTTTGGTCTGGGCGAGACGGTAACTTCCGGGATTGTCTCTGCGCTGGGGCGTAGCGGCCTGAATGCCGAAAACTACGAAAACTTCATCCAGACCGATGCAGCGATCAACCGTGGTAACTCCGGTGGTGCGCTGGTTAACCTGAACGGCGAACTGATCGGTATCAACACCGCGATCCTCGCACCGGACGGCGGCAACATCGGTATCGGTTTTGCTATCCCGAGTAACATGGTGAAAAACCTGACCTCGCAGATGGTGGAATACGGCCAGGTGAAACGCGGTGAGCTGGGTATTATGGGGACTGAGCTGAACTCCGAACTGGCGAAAGCGATGAAAGTTGACGCCCAGCGCGGTGCTTTCGTAAGCCAGGTTCTGCCTAATTCCTCC > NC_000913/181269‑181855 | acaacCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGATTCTGATGCACTGCGCGTGGGTGATTACACCGTAGCGATTGGTAACCCGTTTGGTCTGGGCGAGACGGTAACTTCCGGGATTGTCTATGCGCTGGGGCGTAGCGGCCTGAATGCCGAAAACTACGAAAACTTCATCCAGACTGAt > 1:749976/1‑299 (MQ=255) 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ggCCTGAATGCCGAAAACTACGAAAACTTCATCCAGACTGATGCAGCGATCAACCGTGGTAACTCCGGTGGTGCGCTGGTTAACCTGAACGGCGAACTGATCGGTATCAACACCGCGATCCTCGCACCGGACGGCGGCAACATCGGTATCGGTTTTGCTATCCCGAGTAACATGGTGAAAAACCTGACCTCGCAGATGGTGGAATACGGCCAGGTGAAACGCGGTGAGCTGGGTATTATGGGGACTGAGCTGAACTCCGAACTGGCGAAAGCGATGAAAGTTGACGCCCAGCGCGGTGCt > 1:69265/1‑300 (MQ=255) aCTACGAAAACTTCATCCAGACTGATGCAGCGATCAACCGTGGTAACTCCGTTGGTGCGCTGGTTAACCTGAACGGCGAACTGATCGGTATCAACACCGCGATCCTCGCACCGGACGGCGGCAACATCGGTATCGGTTTTGCTATCCCGAGTAACATGGTGAAAAACCTGACCTCGCAGATGGTGGAATACGGCCAGGTGAAACGCGGTGAGCTGGGTATTATGGGGACTGAGCTGAACTCCGAACTGGCGAAAGCGATGAAAGTTGACGCCCAGCGCGGTGCTTTCGTAAGCCAGGTTc < 2:749976/300‑1 (MQ=255) aTCCAGACTGATGCAGCGATCAACCGTGGTAACTCCGGTGGTGCGCTGGTTAACCTGAACGGCGAACTGATCGGTATCAACACCGCGATCCTCGCACCGGACGGCGGCAACATCGGTATCGGTTTTGCTATCCCGAGTAACATGGTGAAAAACCTGACCTCGCAGANGGTGGAATACGGCCAGGTGAAACGCGGTGAGCTGGGTATTATGGGGACTGAGCTGAACTCCGAACTGGCGAAAGCGATGAAAGTTGACGCCCAGCGCGGTGCTTTCGTAAGCCAGGTTCTGCCTAATtcctcc > 2:260164/1‑300 (MQ=255) | ACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGATTCTGATGCACTGCGCGTGGGTGATTACACCGTAGCGATTGGTAACCCGTTTGGTCTGGGCGAGACGGTAACTTCCGGGATTGTCTCTGCGCTGGGGCGTAGCGGCCTGAATGCCGAAAACTACGAAAACTTCATCCAGACCGATGCAGCGATCAACCGTGGTAACTCCGGTGGTGCGCTGGTTAACCTGAACGGCGAACTGATCGGTATCAACACCGCGATCCTCGCACCGGACGGCGGCAACATCGGTATCGGTTTTGCTATCCCGAGTAACATGGTGAAAAACCTGACCTCGCAGATGGTGGAATACGGCCAGGTGAAACGCGGTGAGCTGGGTATTATGGGGACTGAGCTGAACTCCGAACTGGCGAAAGCGATGAAAGTTGACGCCCAGCGCGGTGCTTTCGTAAGCCAGGTTCTGCCTAATTCCTCC > NC_000913/181269‑181855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |