| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,388,891 | C→T | intergenic (‑80/‑39) | tpx ← / → ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,388,891 | 0 | C | T | 99.0% | 328.9 / NA | 98 | intergenic (‑80/‑39) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (45/52); minor base G (0/1); total (45/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACTTACGTACTGATGCGGCGCAAACACCGGTATCAATACTCGGGAAAATGTTCAGCACTTTGCGTTTACCCGCAAACTGACCGAGGGTGACGTCAGACAGATCTTTTGCCACGAGAGTAAAAGTCTGCGCTTTGCTACCCGCCTGCGGGATGGAATTGGCGACTGTAACCGGGTTGCCCTGGAAATGAACGGTTTGTGACATGATTATCTTTCCTGTTTACATATAGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAA‑GGAGTAAAGATGAGAACCGTTAAGGTATTCGAGGAAGCCTGGCCCTTACATACCCCGTTTGTGATTGCCCGGGGAAGTCGCAGTGAAGCGCGCGTGGTGGTGGTTGAACTGGAAGAAGAGGGTATTAAAGGCACCGGCGAATGCACGCCGTATCCGCGTTATGGGGAAAGTGATGCCTCGGTAATGGCGCAAATTATGAGCGTCGTGCCGCAACTAGAGAAAGGGCTGACACGGGAGGAGTTGCAAAAAATTCTCCCTGCCGGCGC > NC_000913/1388609‑1389186 | aaCTTACGTACTGATGCGGCGCAAACACCGGTATCAATACTCGGGAAAATGTTCAGCACTTTGCGTTTACCCGCAAACTGACCGAGGGTGACGTCAGACAGATCTTTTGCCACGAGAGTAAAAGTCTGCGCTTTGCTACCCGCCTGCGGGATGGAATTGGCGACTGTAACCGGGTTGCCCTGGAAATGAACGGTTTGTGACATGATTATCTTTCCTGTTTACATATAGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGTGCTTACTCCGCAGacca > 2:783984/1‑300 (MQ=255) 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tttGTGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAA‑GGAGTAAAGATGAGAACCTTTAAGGTATTCGAGGAAGCCTGGCCCTTACATACCCCGTTTGTGATTGCCCGGGGAAGTCGCAGTGAAGCGCGCGTGGTGGTGGTTGAACTGGAAGAAGAGGGTATTAAAGGCACCGGCGAATGCACGCCGTATCCGCGTTATTGGGAAAGTGATGCCTCGGTAATGGCGCAAATTATGAGCGTCGTGCCGCAACTAGAGAAAGGGCTGACACGGGAGGAGTTGCAAAAAATTCTCCCTGCCGgcgc < 2:427520/300‑1 (MQ=255) | AACTTACGTACTGATGCGGCGCAAACACCGGTATCAATACTCGGGAAAATGTTCAGCACTTTGCGTTTACCCGCAAACTGACCGAGGGTGACGTCAGACAGATCTTTTGCCACGAGAGTAAAAGTCTGCGCTTTGCTACCCGCCTGCGGGATGGAATTGGCGACTGTAACCGGGTTGCCCTGGAAATGAACGGTTTGTGACATGATTATCTTTCCTGTTTACATATAGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAA‑GGAGTAAAGATGAGAACCGTTAAGGTATTCGAGGAAGCCTGGCCCTTACATACCCCGTTTGTGATTGCCCGGGGAAGTCGCAGTGAAGCGCGCGTGGTGGTGGTTGAACTGGAAGAAGAGGGTATTAAAGGCACCGGCGAATGCACGCCGTATCCGCGTTATGGGGAAAGTGATGCCTCGGTAATGGCGCAAATTATGAGCGTCGTGCCGCAACTAGAGAAAGGGCTGACACGGGAGGAGTTGCAAAAAATTCTCCCTGCCGGCGC > NC_000913/1388609‑1389186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |