| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,248,115 | G→A | L334F (CTC→TTC) | dhaM ← | dihydroxyacetone kinase subunit M |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,248,115 | 0 | G | A | 97.8% | 298.3 / NA | 91 | L334F (CTC→TTC) | dhaM | dihydroxyacetone kinase subunit M |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (57/32); minor base C (1/1); total (58/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGTGGGATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCCGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAGTTCGCTTGCCGCCGCCAGCAGTTCCGGATCATCTAACAGTGTATGGTGACCAGAAAAGATTGCGGCAATATCGTCAAGCCCGCTGGCTTCTGCTTTCGCTGTTAACGTCATCAGATCTAATAACGTGAAGTCAATAGCCTGGCGTAATCGATCTTGTTCTTCTTCCACGGTCAGGGTTGATTTTGCCTGTACCG‑TACATAAAACTGGTTGATAATAAAAGGCTTTACCCGAAACAGGCGGAACGGGACGCAGAGTAGGTGGAGCGACTTCCTCCGTTTCACCAAAGTTATCTT > NC_000913/1247823‑1248408 | cTGTGGGATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTACGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCCGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAATTCGCtt > 1:292440/1‑300 (MQ=255)cTGTGGGATACCGGACNTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATANTCTGCCGTGCAATGTTCANGCTGAAGGAATTCGCtt > 1:661891/1‑300 (MQ=255) gtgGGATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCAGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAATTCGCTTgc > 2:671199/1‑300 (MQ=255) gtgGGATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTGGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTATGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCCGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAATTCGCTTgc > 2:691693/1‑300 (MQ=255) gtgGGATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTACGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCCGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAATTCGCTTgc > 1:541803/1‑300 (MQ=255) ggATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATTTTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCTGCCAGGCATATTCTGCCGTGCAATGTTCATGCTGAAGGAATTCGCTTgccgc > 1:766273/1‑300 (MQ=255) ggATACCGGACTTCCGGCGCTAAGGCAGATACCTTTTACAACCGCCGGATCCAGTTGCAGTACTGTGGAAGGATAAATGTTCTCCGCCAGTAGAATAGTTGGCGAGTTAAACTGCGGGAGTTCTTCTTTCGTTTGGGTCAGGTGGACCAGGGTGCGATGCAGAAGATCGTCCACATCAATATAGCGAGCTTGTAGATATTCATCATCCAGTTGCTGGTATTGCTGGCTAAGTTCTTTAAGAACTTGCCGCCAGGCATATCCTGCCGTGCCATGTTCATGCTGAAGGACTTCGCTTgccgc > 1:766328/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |