| New junction evidence | |||||||||||
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GACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGT‑ATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCG‑CAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACC > NC_000913/780621‑781217 | gACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGTTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGTCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTGAGTTGTAGTATCCAGCGTAGT‑ATCGGGGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 1:350372/299‑1 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2:668679/1‑137 (MQ=2) tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCGTAACGGTGGGTTCAGTGGAAGTAGTTTGTAGTCCCCAGCGACA‑TATCGAGTGATTCGCTCAGCTAGGAGAGCCCCTCCCTCACAAAGAGGGGGTCGGCGATTCGACCCCATCACCACCCACCCCCCAGGTCGttcact > 1:275894/1‑296 (MQ=17) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGACGACAGATGTTCAGCGTGTAGGATACCTTTACGTCCACAACAGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATAATGa > 1:209728/1‑164 (MQ=14) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCAc > 1:489684/1‑149 (MQ=255) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTGAAGCGTGGAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCAc < 2:489684/149‑1 (MQ=14) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |