| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,828,674 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑9/‑267) | gltS ← / → xanP | glutamate:sodium symporter/xanthine:H(+) symporter XanP |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 122 (1.750) | 74/588 | 0.0 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3828678 | 0 (0.000) | intergenic (‑13/‑267) | gltS/xanP | glutamate:sodium symporter/xanthine:H(+) symporter XanP | |||||
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gtctaCTTTGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCNAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGNTTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCa > 2:421395‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaCTTTGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCa > 1:75695‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaCTTTGTATCCGCATCAATCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTAATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTc > 1:186477‑M2/6‑299 (MQ=255) 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GATGCCAACCACACGCCCACCGGCACGCAAACTGGCAATGTTGGCGTTCAGGCCAATGGTGGCGAAGAAAGCCAGCATTAACGGATCGCGCAGGGACATATCAAAGTTGACTTCCCAGCCCATGCTTTTTTTCAGTACTAGTAGCGCCAGCGCCACCAACAAACCACCCGCAACAGGTTCCGGTATGGTGTATTTCTTCAAAAAGGAGACGGAATGGACCAACTTACGCCCGAGCAGCAACGTCAGCGTTGCGGCAACAAGCGTTGCTAAAGTATCGAGATGAAACATAGTTACTCCTTTGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAA > NC_000913/3828378‑3828972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |