| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,656,167 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+18/‑13) | ynfB → / → speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 43 (0.620) | 29/588 | 0.9 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1656171 | 0 (0.000) | intergenic (+22/‑13) | ynfB/speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 41 (0.590) | 33/590 | 0.7 | 97.6% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1656167 = | 1 (0.010) | intergenic (+18/‑17) | ynfB/speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase | |||||
GAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGC‑CGCGTTATTACCCCCTAA‑CCTGTTATTGATTTAAGGAATGTAAGGACACGTTATGCCAAGCGCCCACAGTGTTAAGCTACGCCCGCTGGAGCGTGAAGATTTACGCTATGTACATCAACTCGACAATAACGCCAGTGTGATGCGTTACTGGTTTGAGGAACCCTACGAAGCCTTTGTTGAACTCTCTGATCTGTATGATAAGCATATTCACGATCAGAGCGAACGGCGCTTTGTGGTGGAATGTGACGGCGAAAAAGCCGGTCTGGTGGAGCTGGTGGAAATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGT > NC_000913/1655873‑1656463 | gAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGC‑CGCGTTATTACCCCCTAA‑CCTGTTATTGATTTAAGGAATGt > 1:141339/1‑300 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttagttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGAATGTaa > 2:229490‑M2/293‑300 (MQ=255) aacctgtgctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccatagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGAATGTaa < 2:128723‑M2/8‑1 (MQ=255) caACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGC‑CGCGTTATTACCCCCTAA‑CCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatt < 1:378210‑M2/300‑7 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |