| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 792,077 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑22/+235) | galE ← / ← modF | UDP‑glucose 4‑epimerase/ABC family protein ModF |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 792081 | 0 (0.000) | intergenic (‑26/+235) | galE/modF | UDP‑glucose 4‑epimerase/ABC family protein ModF | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 57 (0.810) | 40/590 | 0.4 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 792077 = | 0 (0.000) | intergenic (‑22/+239) | galE/modF | UDP‑glucose 4‑epimerase/ABC family protein ModF | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCAAGGTCAGCACTACCGACTCAATATATTTTTGTCAGCACATAGCGATAGAGTCCACCGTCCGGCACGAACTCAAGACGAT > NC_000913/791784‑792377 | cgccagttcgcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgatgggttatcgctcgacacgggaatatttgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatctaggggcaaatccaGGTCTGa > 2:42825‑M2/294‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |