| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4094350 | 65 (0.930) | 6 (0.100) | 6/508 | 3.5 | 10.0% | intergenic (‑78/+373) | rhaD/rhaA | rhamnulose‑1‑phosphate aldolase/L‑rhamnose isomerase |
| ? | NC_000913 | 4094719 = | 52 (0.860) | intergenic (‑447/+4) | rhaD/rhaA | rhamnulose‑1‑phosphate aldolase/L‑rhamnose isomerase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAATAAACGGTGTATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCA > NC_000913/4094059‑4094619 | cAATAAACGGTGTATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTAAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAGTGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAGATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGc > 2:42752/1‑300 (MQ=255) aaTAAACGGTGTATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGcc < 1:378575/300‑1 (MQ=255) aaaCGGTGCATTTGCACGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCACTGGACAAACCAGGACTGAGTAGTGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAACTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGCAGGCCGGATAAGGCGCTTGCGCCGCATCCGGCAATCACTGCCt > 2:69936/1‑298 (MQ=255) aCGGTGTATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATg < 1:215758/300‑1 (MQ=255) gtATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTCTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGAc > 1:351113/1‑299 (MQ=255) tATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGc < 1:322704/300‑1 (MQ=255) gctgAGCTGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAc < 1:351659/300‑1 (MQ=255) gctgAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGTTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGAGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAGATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAc < 1:545423/300‑1 (MQ=255) gAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGNACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTAt > 2:436307/1‑300 (MQ=255) gAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCAAGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTAt > 2:494239/1‑300 (MQ=255) agctggATATAGCGCGGTTGTTGTTGGAAATTGTCGTGATATGGTTCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACGGAGTAATGTTTTGCATGTTCGGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCAGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCATGCCTACaa < 1:504109/291‑1 (MQ=255) gggATATAGGGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCTTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCTTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTATGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGcc < 2:6928/300‑1 (MQ=255) gggATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTTCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGcc < 2:6901/300‑1 (MQ=255) ggATATAGCTCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTTCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTTGCTTTGATCATNCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGTTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCg < 2:166508/300‑1 (MQ=255) ggATATAGCGCGGTTGTTGGTGTAAATTGTCGTGATATGGTGCAATATCGTCTTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATNCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCACTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCg < 2:166308/300‑1 (MQ=255) ggATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGcc > 2:368540/1‑299 (MQ=255) atatAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGAAGCTGTCGCGTCTTATCAGGCATACAACTATTGCCGAc > 2:296636/1‑300 (MQ=255) ggtggtttgtgtaaaTTGTCGTGAGAGGGTGCGATATCGGCGTCATCCGGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGNGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCAACCTGTAGGcc < 2:401322/288‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCTTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGATTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGTTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTATGcc < 2:452711/300‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCATGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGTTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGATTAATGTTTTGCATGTTCGGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGcc < 2:27117/300‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGcc < 1:515406/300‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGc < 1:539249/299‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCAAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGcc < 1:528638/300‑1 (MQ=255) ggTTCTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGTCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCACATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGcc < 2:351113/300‑1 (MQ=255) gtggtgggtggAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGTTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGc < 2:538588/292‑1 (MQ=255) tggtggAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGATTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATaa < 1:335733/300‑1 (MQ=255) gAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCAc < 1:168847/300‑1 (MQ=255) aTTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTtg < 1:42752/300‑1 (MQ=255) gTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGCCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGCAGGCATGATAAGGCACTtgt > 2:353155/1‑298 (MQ=255) gTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCAGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCACTGCCTGATGCGACGCTATCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCAGAACTGTATGCCTGATAAGGCACTTGTGc > 2:352868/1‑300 (MQ=255) gTCGTGACATGGTGCGGTATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCAGCAGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTAGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACGAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCATAGGCCGGATGCGGCGCTCGCGCCACATCTGGCAGTCCATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAAGACTACCACTATTGCCGACCTGTAGGACTGATAAGGTACTCGTGc > 2:353137/1‑300 (MQ=255) ggTGCGGTATGGGAGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCAAACCTTTAAGCCGGGCGTAGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGCCAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCAGTGTTGTCGGACGCACGAACCGTCGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCACATCCGGCAATCAATGCCTGCTGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGACTa > 2:83383/1‑250 (MQ=255) tatCGGCGTCATCCAGGTGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGTTTTGATCATGCCCTGGACAAACCATGACTGATTAGTGTTTGGCATGTTCTGTGTTTCGGTNAATTCTGTGTTGGCGGATGCACGACCCGTAGGNCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGTGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTTTAGGCCGGATaatgc < 2:416529/275‑4 (MQ=25) ggCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGcc < 1:424006/299‑1 (MQ=255) 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aTCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCAAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGCTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGATCGCGCCGCATCCGGCACTCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCATACCTACAAGTATTGCCGACCTGTAGGCCCGATAAGGTATTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGc > 2:305067/1‑299 (MQ=37) aGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATTCGACGc < 1:321118/300‑1 (MQ=255) aGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGTTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCTGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCt < 1:178430/298‑1 (MQ=255) 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cGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTAAAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATaa > 1:415/1‑298 (MQ=255) cGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGAACTGTAGGc > 1:85/1‑199 (MQ=255) gttggtggtGGCGTGGATCATTTCCTGGAAAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAGTGCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTACCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTCATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGc < 2:112525/297‑1 (MQ=18) ttGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCAt < 1:124687/300‑1 (MQ=255) aaCCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAc > 1:429152/1‑149 (MQ=255) aaCCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAc < 2:429152/149‑1 (MQ=255) aaCCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGcccga > 1:69154/1‑297 (MQ=255) aaCCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt > 1:69139/1‑298 (MQ=255) aaCCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCCGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCCGTAGGCCTGATAAGGAACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCCGGCCTACAATTGTTGCAGACCTGTAGGCCGGATAAGGCCCTTGTGCCGCATCCggaaacccgtacct > 2:325409/1‑286 (MQ=21) cTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGACGGATAAGGCACTTGTGCCGCACCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACga > 2:71740/1‑299 (MQ=255) gtGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATACGGCACTCGTGCCGCATCCGGAAATCCATGCCTGGCGCGACGCTGTCGCGCATCATCAGGCCTACAACCGTTGccaaac > 2:347314/2‑224 (MQ=18) gTTCTGTGTTCCTGTANATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAANCAATGCCTGATGCGACGCNGTCGCGTCTTATCAGGc > 1:470466/1‑300 (MQ=255) gTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGTTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGc < 1:150260/300‑1 (MQ=255) gtgtTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGCCTTATCAGGCCTAc > 2:259071/1‑299 (MQ=255) tgtTCCTGGAAATTCGGTGTCGTCGAATGCACGACCCGTAGTCCGGATAATGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAAGGCCTGATGCTACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCAGCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTTTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACaa < 2:349718/300‑1 (MQ=14) atgtaCGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCACGcc < 2:443772/81‑1 (MQ=11) cccGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCCATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACt > 2:225480/1‑298 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCg < 1:337958/300‑1 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGACAATCACTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCAGACCTGTCGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAATATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCAATTGTGcagaa > 2:225607/1‑296 (MQ=255) | CAATAAACGGTGTATTTGCCAGTAAAGGCATGGGCTGGCTGAGCGGGATATAGCGCGGTTGTTGGTGGAAATTGTCGTGATATGGTGCGATATCGGCGTCATCCAGGCGTAGCGTCAGGTTGCCGCCGTTGCGCTCATCCCAGCCTTTCAGCCAGGCGTCGGTGGTGGCTTTGATCATTCCCTGGACAAACCAGGACTGAGTAATGTTTTGCATGTTCTGTGTTCCTGTAAATTCGGTGTTGTCGGATGCACGACCCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCTGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTGTTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAACTATTGCCGACCTGTAGGCCGGATAAGGCACTTGTGCCGCA > NC_000913/4094059‑4094619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |