| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 82 (1.170) | 62/590 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3134042 | 0 (0.000) | intergenic (‑85/‑89) | yghS/yghT | putative ATP‑binding protein YghS/putative ATP‑binding protein YghT | |||||
GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289821‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGCGCACCTTTT < NC_000913/3134042‑3133748 GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACC < 1:271284/299‑1 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ATATCAGGGGCTTGTTCGCACCTTCCTGAACCATTGTCACAATAAGGGTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTANTATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATTTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATGGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACGTTTATCGCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTa < 1:116334/300‑2 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCac > 2:352229/1‑298 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGT < 1:35688/300‑1 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TTGTTCGCACCTTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTG < 1:223545/299‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGC > 1:318455/1‑300 TGTTCACACCTTCCTTANCCATTGTCACAATAAGGTNGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACNGCTCCCTGTTATTGGC < 1:465961/300‑1 ACCTTCCTTAGCCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGCGCACCTT < 1:309404/300‑1 CCTTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTAGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGCGCACCTTT > 2:492829/1‑300 TTCCTTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTAGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGCGCACCTTTT > 1:270079/1‑299 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GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289821‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACCATTGTCACAATAAGGTTGAACGGATATTCTGAGCACGGACCACGTAATATTCAATACATTATTTACTGCCGGGTTTTTCGTGAATCAACGTAATATGTCAATAATTAATTCCACGCCAGTGCGTGTTATTGCCATTGTAGGATGTGATGGTTCAGGTAAATCGACCCTCACGGCAAGCCTGGTAAATGAACTGGCAGCAAGAATGCCAACAGAACACATTTATCTCGGGCAATCGTCCGGGCGAATTGGCGAATGGATTTCACAGCTCCCTGTTATTGGCGCACCTTTT < NC_000913/3134042‑3133748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |