| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,282,332 | (A)5→6 | coding (744/1293 nt) | yjcF ← | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,282,332 | 1 | . | A | 98.1% | 551.0 / 1.8 | 160 | coding (744/1293 nt) | yjcF | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base A (86/71); total (88/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
AACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGG > NC_000913/4282037‑4282623 | aacagTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATa‑a‑aaa < 1:182278/296‑1 (MQ=255) acagTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTCATTAAATCCAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGACATGTATGCCATATACA‑AAA‑ttt > 2:279013/1‑299 (MQ=255) gAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTCTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGaataat > 2:137275/1‑300 (MQ=255) gCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGCATAATCAAGGAAGGTAt > 1:191376/1‑300 (MQ=255) gCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGACATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTAt > 2:225966/1‑300 (MQ=255) aaaTTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTAttttt < 1:54619/300‑1 (MQ=255) gCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATATAGA‑AAA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAGTAtt > 1:192633/1‑300 (MQ=255) attaAAATTAACATTGGCCATATTAGATTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGctc < 2:344423/300‑1 (MQ=255) tAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCAtt < 1:209774/300‑1 (MQ=255) aCATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCAttgt < 2:480004/300‑1 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCAt < 2:295625/300‑1 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCAt < 2:538349/300‑1 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTa > 2:267854/1‑300 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTa > 1:10298/1‑300 (MQ=255) tAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAAt < 1:295803/300‑1 (MQ=255) agTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAATGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGa > 1:200699/1‑300 (MQ=255) tCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAAc < 1:291256/300‑1 (MQ=255) ggTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAGAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACa > 2:152710/1‑299 (MQ=255) ggTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTTGTCC‑TATTCATTGTTGCATTGTCGAATTGAACAt > 2:151132/1‑300 (MQ=255) ggTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTAACTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACAt > 2:263974/1‑300 (MQ=255) ggTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTAACTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATCGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACAt > 2:150654/1‑300 (MQ=255) gTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCCTTGTAGAATTGAAcct > 2:247408/1‑297 (MQ=255) gTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGCACAt > 2:246969/1‑299 (MQ=255) aCATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGACTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCa > 2:134227/1‑300 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt > 1:161546/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGATGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt < 2:504595/299‑1 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATa > 1:311516/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATa > 2:452470/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTCAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGTAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt < 2:48938/299‑1 (MQ=255) taACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGc > 2:227057/1‑299 (MQ=255) aaCCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCgg < 1:30844/300‑1 (MQ=255) aaCCATTTCGAGGAACGTAGTGGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATCAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCgg < 2:381163/300‑1 (MQ=255) aTTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGATGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAAc < 1:934/299‑1 (MQ=255) aCGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTaga > 2:331500/1‑300 (MQ=255) gTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAatat < 2:253510/239‑1 (MQ=255) tttGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTcc > 2:374553/1‑300 (MQ=255) tttGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTACACCCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAACGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCACGGAAGGTATTTTTCATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGCCCATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTcc > 1:488742/1‑300 (MQ=255) aaaaGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑Tc < 1:482199/300‑1 (MQ=255) gagTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGa > 1:15175/1‑299 (MQ=255) tATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAAtt < 1:60047/299‑1 (MQ=255) aaTTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAg < 2:326080/299‑1 (MQ=255) aTTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTc < 1:441106/300‑1 (MQ=255) atTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATAc > 2:190884/1‑300 (MQ=255) tCTGGAGGTTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTATAGAAGCNAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACaa < 1:117717/300‑1 (MQ=255) ttgatggTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 2:473224/294‑1 (MQ=255) gAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 2:303199/297‑1 (MQ=255) gggTTGCTTTATTCAGGTTGCCACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAACTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCa > 1:313462/1‑300 (MQ=255) gggTTGCTTTATTCAGGTTGACACTA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGCTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAAGTCGGCGCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAACCATGTATGCCAGATA‑AGAAA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCACTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAAGTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 2:11488/295‑1 (MQ=255) aTTCAGGTTGACACGAAGGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCGTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCCTTTTTAAGTCTGAGACGAAATTTGAGTcctc > 1:187632/1‑277 (MQ=255) aTTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCgag < 2:187653/277‑1 (MQ=255) aTTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCgag < 2:187632/277‑1 (MQ=255) ggTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTcc > 1:325819/1‑300 (MQ=255) acacGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 2:450741/1‑300 (MQ=255) acacGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGANTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTNGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 2:424576/1‑300 (MQ=255) a‑‑gaCAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGa > 1:379445/1‑300 (MQ=255) a‑‑gaCAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTNCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGa > 1:108147/1‑300 (MQ=255) gATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTa > 2:282546/1‑300 (MQ=255) gATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTa > 1:542840/1‑300 (MQ=255) aatcaacacactCAAAGTTAACTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGAGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCACGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTAGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGCAAAATTGAACATGCATCGCGGAACACGAATTTAGAGTTCCgtccatcatt > 2:282086/12‑221 (MQ=255) aTCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCGAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTAGGCCATATA‑A‑AAAATTGGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTGTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCg < 2:77377/293‑1 (MQ=255) gTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGtt > 1:276234/1‑300 (MQ=255) aGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATAc < 2:88960/300‑1 (MQ=255) taaATCGAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTAGAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 2:191376/300‑1 (MQ=255) taaATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 1:267854/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 1:227057/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAATCTAAGGTCTGCTCTAAATAAATTAATATATTGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 2:42776/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 2:10298/298‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGGCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 2:461123/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGGTTAGAGAAGCTGAGGGCGGCTCTAAATAAATGAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTatag < 2:184795/300‑4 (MQ=255) aTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGt < 1:193264/300‑1 (MQ=255) aaGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTcc < 1:390052/299‑1 (MQ=255) gTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGa > 1:88456/1‑300 (MQ=255) gTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAAAGTCCTGa > 1:210784/1‑300 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATGAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCNTTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGaaa < 2:166152/294‑1 (MQ=255) aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGc > 2:530455/1‑299 (MQ=255) gCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGACTTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATCTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTACTGCAAAATAGCGt > 2:259385/1‑300 (MQ=255) gCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCACTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGt > 1:230698/1‑300 (MQ=255) tCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAg < 1:151132/300‑1 (MQ=255) gCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCt > 1:310333/1‑300 (MQ=255) aatTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCa > 1:525358/1‑300 (MQ=255) gcTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGa > 2:313596/1‑300 (MQ=255) cTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGAt > 1:146688/1‑300 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAATGAAGGTATTTTTAATAGTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 2:192633/300‑1 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 2:97005/300‑1 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 1:169322/300‑1 (MQ=255) taAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATc < 1:134258/300‑1 (MQ=255) taAAGATTTACCTCAACCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATc < 1:134227/300‑1 (MQ=255) ttACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATc < 2:242766/300‑1 (MQ=255) cAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATa > 1:363712/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATAcc > 1:265968/1‑300 (MQ=255) cATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑NGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCtt > 2:397065/1‑300 (MQ=255) cATGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCtt > 1:353172/1‑300 (MQ=255) aTGTATGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATCTTACCGTCCTGACAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCCACCTGCAAAATTCGAATTGGATAACTCTTCATCTTTAATCACGATAACttt > 2:115476/1‑300 (MQ=255) tgccatagaa‑a‑aaa‑TGTGAATAATCAAGGAAGATATGTTGAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACAGGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTAGCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTGATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTGCATCTTTAATCACGATACCTTTCAgg < 2:373111/290‑1 (MQ=255) tGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAATTAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTTTTGCATTTTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGTCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGc < 2:21071/300‑1 (MQ=255) tGCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGc < 1:25866/300‑1 (MQ=255) gCCATATA‑A‑AAAATTTGAATAAGCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCTGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCt < 2:269825/300‑1 (MQ=255) tataa‑a‑aaa‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAgg < 1:344412/296‑1 (MQ=255) ataa‑a‑aaa‑TTTGAATAATCCAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTTTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAATATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCATGCTAAgg < 2:73301/296‑1 (MQ=255) taa‑a‑aaa‑TTTGACTAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTTAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAgg < 2:161546/296‑1 (MQ=255) | AACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGA‑‑GACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATATA‑A‑AAA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTC‑TATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTA‑‑TCTGAG‑CGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGG > NC_000913/4282037‑4282623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |