| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,704,350 | Δ390 bp | blr | blr | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCCGCAATCAGGGGCGCATGGAAGGTTTTGCTCGCATAACCATACCCAATCAACCCAACACGGATGTTGTCGCTCATGTCATTGCCTCTCATTGAAGTATGATGGCTATTTGACACTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1704059‑1704349‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATTACACCC > NC_000913/1704740‑1705036 CCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCCGCAATCAGGGGCGCATGGAAGGTTTTGCTCGCATAACCATACCCAATCAACCCAACACGGATGTTGTCGCTCATGTCATTGCCTCTAATTGAAGTATGATGGCTATTTGACACTAAACCAGGAA > 2:328684/1‑300 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CTATTTGACACTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTT > 1:108153/1‑300 TTGACACTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTTTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCATAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATT < 2:641941/300‑1 TGACACTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATT < 1:161670/299‑1 ACACTAAACCATGAATTTATTATCTTGTTCTATTTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATTAC < 2:24348/299‑1 CACTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATTACAC > 1:265631/1‑300 CTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTNAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATTACACCC > 1:118575/1‑300 CCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCCGCAATCAGGGGCGCATGGAAGGTTTTGCTCGCATAACCATACCCAATCAACCCAACACGGATGTTGTCGCTCATGTCATTGCCTCTCATTGAAGTATGATGGCTATTTGACACTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1704059‑1704349‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAACACAAGCGTTCACTTTTGGTGAAATTTTATCATCACTAATAATACCTACCCCTTTGGTATTAATTATTTTATGGACCTTTTATGACTGTTCAGGACTACTTATTAAAATTTCGCAAAATCAGTTCACTCGAAAGTCTGGAAAAACTCTACGACCATCTTAATTACACCC > NC_000913/1704740‑1705036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |