| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,651,851 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+1866/+873) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 69 (0.860) | 40/588 | 0.7 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1651855 | 0 (0.000) | intergenic (+1870/+873) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1651851 = | 0 (0.000) | 97 (1.210) | 62/588 | 0.1 | 100% | intergenic (+1866/+877) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651262‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGCGT < NC_000913/1651855‑1651559 TTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATC < 1:493810/300‑1 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GAACCTAAGAACGCGTCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAA < 2:66241/300‑1 GAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAATCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAA < 2:419206/300‑1 AACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCATAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAAC < 1:312881/300‑1 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GTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGAT < 1:443284/300‑1 GACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATACCGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACAAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGACGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTCTGCTCAGGATATTTTTGATGA > 2:106247/1‑300 CATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCA > 1:566684/1‑300 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CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCGGTAACTCTTTCCGAACCTCCAATAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCCGGATATTTTTGATGCCGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCCGTTTCTTTCCGTGCCAGAAATTTTTCAACCAGTTCTTTTCTGGTTACATCTTGTAGGGCCTCACCAAACTTTTCCAGATTGCGTGGGGGAGGAAACTGTTT > 1:195183/1‑300 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCAATGAGGCAAGATTTTTTTCCCCGATTATGCTCAGGATACTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTCTGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGC > 2:525981/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTCCGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTCTTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGT > 1:1844/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACATACAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGACATTTTTGATGACGGAACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCAACAAATTTTTCCAGATTGCGTGGGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGT > 2:341345/1‑300 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACCCTTTAAGAACCTCCAGTAGTTTCTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGGTGTTTTTGATGACGGCACGGTGTGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCGGAAATTTTTCAACCAGTTCTTTTATTGTTAAATCTTGTAGGGCCTCCCCAAATTTTTCAAGATTGCGTGGGGAGGGAAACTGTTTTGCCTAGTCGAAAA > 2:137866/1‑300 TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAGCTCTTTACGAACCTCAAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCAGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAACCTGTTTTGCATAGTCGAAAACAaca > 2:211789/1‑297 TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTTTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTAACCAACTTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGCCGAAAACACCA > 2:211773/1‑300 accGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGGTCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATTGGTGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATACTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCCGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTCTGGTTAAATCTTGTCTGGCCTCACCAACTTCTTCCAGATTGTGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGT > 2:636417/4‑300 TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTA > 1:405356/1‑300 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NC_000913/1651262‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGCGT < NC_000913/1651855‑1651559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |