| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,262,279 | Δ6,678 bp | [fruK]–[lpxT] | [fruK], fruB, setB, yeiW, yeiP, yeiQ, yeiR, [lpxT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2262279 | 2268956 | 6678 | 85 [0] | [2] 87 | [fruK]–[lpxT] | [fruK],fruB,setB,yeiW,yeiP,yeiQ,yeiR,[lpxT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2262278 | 0 (0.000) | 85 (1.030) | 54/588 | 0.2 | 100% | coding (88/939 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase |
| ? | NC_000913 | 2268957 = | 0 (0.000) | coding (104/714 nt) | lpxT | lipid A‑core phosphotransferase | |||||
GATGACCTGCACATTGAAACGCAAAACGTTGCGCCACCGGACAGCCGTATTGAGCTGATTTCCAGCAGCGAAGCTGACTGGAATGCCTTGCAGAGCGCGCTGTTGAAGCTTCGTTTAGCGACTACCGCGTAAGGTTGCCTGCGTTTTTCAGTAAGATAATTAGAGAAAATATGATTAAAAATTTGCCGCAAATAGTGTTGTTGAATATTGTCGGCCTCGCGCTGTTTCTTTCCTGGTATATCCCCGTTAATCATGGATTCTGGTTGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTG‑GCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTC > NC_000913/2268684‑2269255 | gcgttcccagtcggcgggggtgacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTCTTTCTTTAATc > 2:250524‑M2/274‑300 (MQ=255) agtcggcgggggtgacttcaaaaccctagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAAc < 1:249325‑M2/33‑1 (MQ=255) gactgcaacacccgagaagttgaaggcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcgatgcccagctcgcggaacagttgctgaaaaccatccttattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgaggcctctacccgccgcatgcagaccgttggttgtcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAgg < 2:143533‑M2/48‑1 (MQ=255) gactgcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaactttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccaccaacgttgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccgggggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAgg < 2:143526‑M2/48‑1 (MQ=255) gaattcaaaaaccgataagttgaagttcgtcacttcgccgtctttgcccggcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgcttaatagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccgggtcttttaatactttggccacgttgatgcttttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTGTTTATTTCCTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAgg < 2:143525‑M2/48‑1 (MQ=255) cttcaaaacccgaggagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGTGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGc > 1:253337‑M2/251‑299 (MQ=255) cttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGcc > 1:252929‑M2/251‑300 (MQ=255) 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gggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTG‑GCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATggg < 1:95503‑M2/115‑1 (MQ=255) ggtgcgcccctgtacaacctgtaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTG‑GCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTa < 1:303284‑M2/117‑1 (MQ=255) ggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTG‑GCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTa < 1:302993‑M2/117‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |