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TTGGCAGCATCACCTAAGGA‑‑GTGATTCGATTTCACTA‑TGGGTCAGG‑AAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATG‑CTATGTACCTTTATATAT < 1:372208/300‑1 gcacGCATCACCGAAGGNC‑GTGATTCGATTTCACTANTGGGTCAGGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGNCTATGTACCTTTATAT < 1:539608/296‑1 agcgATCACCTAAGGANGGTGATTCGATTTCACTANTGGGTCAGGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGCGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGNCTATGTACCTTTATAT < 1:539290/295‑1 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CACCTAAGGA‑‑GTGATTCGATTTCACTA‑TGGGTCAGG‑AAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTACCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATG‑CTATGTACCTTTCTATATTTATCAATC > 2:188216/1‑299 CCTAAGGA‑‑GTGATTCGATTTCACTA‑TGGGTCAGG‑AAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGNTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTANCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATG‑CTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA > 2:494026/1‑300 CCTAAGGA‑‑GTGATTCGATTTCACTA‑TGGGTCAGG‑AAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCAATACAAACGCCATGCTCTTGCATG‑CTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA > 2:579207/1‑300 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NC_000913/1978978‑1979270‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAGGA‑‑GTGATTCGATTTCACTA‑TGGGTCAGG‑AAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATG‑CTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA < NC_000913/4541023‑4540726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |