| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,508,810 | C→T | intergenic (‑193/‑199) | insI3 ← / → insO | IS30 family transposase/IS911B regulator fragment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,508,810 | 0 | C | T | 98.4% | 393.5 / NA | 121 | intergenic (‑193/‑199) | insI3/insO | IS30 family transposase/IS911B regulator fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (56/63); minor base G (0/2); total (56/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
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ggcggTAATCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCNAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTATTTCAGGAAGGAGTGTCCGTTAAACTCAGGCTACCTCAGGAAAAACCGTCCTGAAAAACCAGACGGCAGACGGGCTGTATTACGCAGTCAGGTACTTGAGCTACATGGCATCAGCCACGGTTCGGCCGGAGCa < 1:135929/300‑1 (MQ=255) ggcggTAATCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTATTTCAGGAAGGAGTGTCCGTTAAACTCAGGCTACCTCAGGAAAAACCGTCCTGAAAAACCAGACGGCAGACGGGCTGTATTACGCAGTCAGGTACTTGAGCTACATGGCATCAGCCACGGTTCGGCCGGAGCa < 1:110674/300‑1 (MQ=255) gcggTAATCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTATTTCAGGAAGGAGTGTCCGTTAAACTCAGGCTACCTCAGGAAAAACCGTCCTGAAAAAACAGACGGCAGACGGGCTGTATTACGCAGTCAGGTACTTGAGCTACATGGCATCAGCCACGGTTCGGCAGGAGcca > 2:119201/1‑298 (MQ=255) | GTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTATTTCAGGAAGGAGTGTCCGTTAAACTCAGGCTACCTCAGGAAAAACCGTCCTGAAAAACCAGACGGCAGACGGGCTGTATTACGCAGTCAGGTACTTGAGCTACATGGCATCAGCCACGGTTCGGCCGGAGCAAGAA > NC_000913/4508518‑4509105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |