| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,789,274 | 0 | C | A | 24.2% | 247.4 / 10.8 | 120 | E270* (GAG→TAG) | waaH | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/46); new base A (29/0); total (74/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.01e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CTGATCGTTTACTTCCAGCATCAGTGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAATAACATCACGGC > NC_000913/3788980‑3789567 | cTGATCGTTTACTTCCAGCATCAGTGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGAACGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTaa > 2:28922/1‑299 (MQ=255) cTTCCAGCATCAGTGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGAACGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATCAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAGTCAGGCGCTTATACATACCAGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGCAAGTTATTTGCt > 1:125122/1‑298 (MQ=255) gCATCAGTGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAAt < 1:206392/300‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAGTTCCGGAt > 2:590500/1‑300 (MQ=255) tGGCAAGGCCGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATTGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGAt < 2:329843/300‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCa > 1:238984/1‑300 (MQ=255) ggggCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCAt > 2:404304/1‑297 (MQ=255) gggCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCACAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAAtt < 2:103092/300‑1 (MQ=255) ggCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAAttt > 2:640297/1‑300 (MQ=255) ggCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCATCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAAttt > 2:311555/1‑300 (MQ=255) aGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTaa > 2:483665/1‑300 (MQ=255) gTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGAATGGCAAACACGCAATGCATAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGAATAATTTCGAtttcat > 2:269464/1‑297 (MQ=255) aaTTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCAAGCAGGc > 2:7934/1‑297 (MQ=255) tACGCGTAGTGTGACGGTGCTACCACGCTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCTGAAAGACCACAGTAACGTCTGGTAACCTACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCTGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAACTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTTCAGCAGGCGGGTAATCTTAatat < 2:111927/300‑1 (MQ=255) gcgTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAANTTATTTGCTGATGAAATTCAGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGt > 2:549201/1‑300 (MQ=255) gcgTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGt > 1:158886/1‑300 (MQ=255) gcgTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCAGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCAAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGt > 2:60908/1‑300 (MQ=255) gcgTAATGCGATGGTGCGAACGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAANTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGt > 2:549209/1‑300 (MQ=255) tAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCAGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGAc > 1:58383/1‑300 (MQ=255) aTGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGt > 1:530302/1‑300 (MQ=255) aTGGTGCGGCCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGANTATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACANGCGATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGGTGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTGATTTCTCCAGTAGGCGGGTAATCTTAgtat < 2:526563/287‑1 (MQ=255) ggTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAAt < 1:524891/300‑1 (MQ=255) gTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAAtt > 1:444890/1‑300 (MQ=255) gcgTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACTCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCAAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGtttt > 1:122732/1‑300 (MQ=255) gcgTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAatatctgtctcttatacacatctcgc < 1:686736/298‑23 (MQ=255) gcgcCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTg < 1:628508/300‑1 (MQ=255) cgcCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGCTAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGt > 2:282860/1‑300 (MQ=255) aaGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa > 1:540446/1‑300 (MQ=255) aGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGa < 2:580388/300‑1 (MQ=255) gACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGAc > 2:445824/1‑300 (MQ=255) ccACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGATAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCAGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTGGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAACGACTCACTGACGt > 2:168489/1‑300 (MQ=255) ccACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAGGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCATAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGCCGt > 1:105574/1‑300 (MQ=255) caGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGAATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGtatt > 1:187751/1‑300 (MQ=255) caGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGAATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGtatt > 1:187069/1‑300 (MQ=255) tAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAAGCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGtat < 2:172629/296‑1 (MQ=255) aaCGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGc < 1:540425/300‑1 (MQ=255) aaCGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAANTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTNCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGc < 2:521840/300‑1 (MQ=255) cGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCa > 1:326252/1‑299 (MQ=255) ccTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGa > 2:201587/1‑299 (MQ=255) tGGTAACCGACCTTCANGCTGCGCACATTGGTAATNAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTNACGTATTATGCAGata < 1:574019/299‑1 (MQ=255) gTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTAGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGataata > 1:219353/1‑300 (MQ=255) aCCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTtatat < 1:672185/300‑1 (MQ=255) acaTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGt < 1:612622/299‑1 (MQ=255) caTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCCATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGtat > 1:243188/1‑300 (MQ=255) caTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGtat > 1:243320/1‑300 (MQ=255) caTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATCATGATTGCTCGGtat > 2:7620/1‑300 (MQ=255) caTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGtat > 1:108024/1‑300 (MQ=255) caTTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCATCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGtat > 1:243736/1‑300 (MQ=255) ttGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAACGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTatat > 2:167278/1‑300 (MQ=255) ttGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGGAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTGCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATATTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTTCTCGGTatat < 2:474858/300‑1 (MQ=255) gggaaTCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATGTCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACTTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATcg < 2:133029/297‑1 (MQ=255) gTAATCATGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATcgc < 2:474163/300‑1 (MQ=255) gTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATcgc < 1:340198/300‑1 (MQ=255) gTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATcgc > 2:24964/1‑300 (MQ=255) gTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGCTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATACTAATTGCTCGGTATATcgc > 2:25739/1‑300 (MQ=255) aTCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGACATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATCTAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTCTGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATCATATCTATATAATGATTGCTCGGTATATCGcgca > 2:310680/1‑300 (MQ=255) cgcTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTCAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCATAGTAAGTTATTTGCTAACGAAATCCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATACTTTCGATTTAATTTCTNCAGTAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATCTCGcgcacgca > 2:203054/1‑298 (MQ=255) cgcTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCC‑TTGTCTATGCAACCg < 2:480809/235‑1 (MQ=255) cgcTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTCAGGTTTTTATTCC‑TTGTCTATGCAACCg > 1:480809/1‑235 (MQ=255) cgcTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGCTTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgc > 2:655736/1‑300 (MQ=255) cgcTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgc > 1:189381/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTTTTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcgc > 1:671588/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGCCGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcgc > 1:168637/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcgc > 2:419253/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcac > 1:168422/1‑298 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcgc > 1:168795/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCACACGCAgcgc > 2:29653/1‑300 (MQ=255) cTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGAATCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAgcgc > 2:147044/1‑300 (MQ=255) atacatacCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGtt > 1:529694/1‑300 (MQ=255) atacCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCTGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCTGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAc < 2:340747/300‑1 (MQ=255) atacCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAc < 1:423752/300‑1 (MQ=255) atacCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAc < 1:672143/300‑1 (MQ=255) atatCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATACTTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTCTTATGCAGATAATATTTATATCATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCtgtt > 2:39111/1‑299 (MQ=255) atatCTAGGCAATCATCCGCTGGAGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAGGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAGTTTCGATTTAATTTCTACAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTCTTCCCTTGTCCATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCCGATAATATTTATATACTGATTGCTCGGTACATCgcgcccatagcacggtaaacacgacgtctggt > 2:41360/1‑271 (MQ=255) tctcGTCAATCATCCGTTGGTGGGTAAGAATATCCGGCTCTTCGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTAATGAAATGCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGTTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTGATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTcc < 2:341756/300‑1 (MQ=255) tctcGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATTGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATATTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTcc < 2:341722/300‑1 (MQ=255) tctcGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTcc > 1:600584/1‑300 (MQ=255) ggCAATCATCTGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATGTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTGCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCACACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGAc < 1:459225/300‑1 (MQ=255) gCAATCATCCGTTGGCGGTTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCATGCGGGTAATCTTAATATATTGNCGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTNTGCAACCTACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACa < 2:513497/300‑1 (MQ=255) gCAATCATCCGTTGGCGGTTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACa < 1:362839/300‑1 (MQ=255) gCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTTTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCGTAATATAGTGACATTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGata < 2:11166/300‑3 (MQ=255) aaTCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATTGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAat < 1:644429/300‑1 (MQ=255) atcCGTTGGCGGGTAAGAATATCCTGCTCTTTGCGCACCGCATTGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATATTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATcc < 1:104748/300‑1 (MQ=255) ttGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCtgatg < 1:28922/300‑1 (MQ=255) ttGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGAGAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTTTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCtgatg < 1:30200/300‑1 (MQ=255) ggCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTgatgat > 1:329338/1‑300 (MQ=255) ggggaagaagATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACTCACTGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGatgatg < 2:122732/294‑1 (MQ=255) ggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACCTGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTaa > 2:458169/1‑300 (MQ=255) gAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATcc > 1:397235/1‑298 (MQ=255) tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTa > 1:365657/1‑300 (MQ=255) ctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAAGTTaa > 2:299641/1‑300 (MQ=255) tttGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATNTCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAAt > 1:144173/1‑300 (MQ=255) ccGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTAtttt > 1:349034/1‑300 (MQ=255) ggCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACaa > 2:601016/1‑300 (MQ=255) ggCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTAGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCCGCAGGAGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAAATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCATGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTCATGTTATTTTTAAcca > 2:598122/1‑298 (MQ=255) aaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGAGGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTTCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAATAAc < 2:697041/300‑1 (MQ=255) acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAATAACa > 1:248708/1‑300 (MQ=255) acacGCAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAAtcac > 1:349611/1‑296 (MQ=255) aTGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAATAACATCACGGc < 1:282860/300‑1 (MQ=255) tGCCTCGTAAGTTATTTGCTTATTAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAGTTTCGTCAGCAGGCTGGCAATCTTaacac < 2:172521/98‑4 (MQ=255) | CTGATCGTTTACTTCCAGCATCAGTGGCAAGGCTGGGGCAAACAGCCCGAAGCGGCGAAGTTTAACGCTAGCGCAAATTAAAGGCGCTACGCGTAATGCGATGGTGCGACCGCGTTTTGTCGCGCCATTGCCATAAGCGGAAAGACCACAGTAACGCCTGGTAACCGACCTTCACGCTGCGCACATTGGTAATCAGGCGCTTATACATACCGGAAGTAAATATCTCGGCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCAGACAATATCCTGATGATGTAATCCGGCAATAAATTTAATGTTATTTTTAACAATAACATCACGGC > NC_000913/3788980‑3789567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |