| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,546,574 | IS2 (+) +5 bp | coding (16‑20/1317 nt) | gntT → | high‑affinity gluconate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3546574 = | 0 (0.000) | coding (16/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 107 (1.220) | 64/584 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3546578 | 0 (0.000) | coding (20/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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AGATTCAGGGGGCCAGTCTATCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGGGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAAC < 2:61037/292‑1 GATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATAC < 1:680783/206‑1 GATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATAC > 2:680783/1‑206 TCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGAC < 1:475633/300‑1 AGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGTTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGC < 1:660516/300‑1 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTANAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 2:500916/1‑300 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 2:316461/1‑300 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCAACAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGCGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 2:38625/1‑300 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCCTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGTAACATAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGGAGTCAGATGTCAGGNGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGC < 2:489808/299‑1 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT < NC_000913/3546578‑3546284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |