| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,303,314 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (416‑421/921 nt) | oppB → | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 90 (1.030) | 57/582 | 0.2 | 98.9% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1303314 = | 1 (0.010) | coding (416/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1303319 | 0 (0.000) | 78 (0.890) | 43/580 | 0.6 | 100% | coding (421/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| ? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
TGATGGCCAATATCGAAGCGAAATATCATCTTAATGATCCGATCATGACACAGTATTTCAGCTACCTGAAACAACTGGCGCACGGTGATTTCGGTCCATCGTTTAAATATAAAGATTATTCGGTCAATGACTTGGTTGCATCCAGTTTTCCCGTTTCTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1303032‑1303319‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAGCG > NC_000913/2514273‑2514569 TGATGGCCAATATCTAAGCGAAATATCATCTTAATGATCCGATCATGACACAGTATTTCAGCTACCTGAAACAACTGGCGCACGGTGATTTCGGTCCATCGTTTAAATATAAAGATTATTCGGTCAATGACTTGGTTGCATCCAGTTTTCCCGTTTCTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGC < 2:617514/300‑1 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CATCCAGTTTTCCCGTTTCTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTACCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGACAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTACGCACGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTACTGCCGGGGCTCT > 2:139692/1‑300 AGTTTTCCCTTTTCTTCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTTCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGTCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATTGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTNAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTANCGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAC < 2:527097/298‑1 AGTTTTCCCGTTTCTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACC < 1:214239/299‑1 CTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATATTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCAGCGAAA > 2:586531/1‑299 CTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAAT > 2:586522/1‑300 TTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTTGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACAATAACTAGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGT < 2:123783/299‑1 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CGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > 1:339641/1‑178 CGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > 1:339601/1‑178 CGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC < 2:339601/178‑1 CGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC < 2:339641/178‑1 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GTAATACTGGGTGTTAGTGCTAGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTCAGGGTTGTGGTATTACGCATGATATGCTTTACCGTGCCGATAAATTACTCTCCCGGTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACATAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGCTGCTGCAA > 2:175160/1‑279 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTCAGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCC > 2:444057/1‑300 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCac > 2:444066/1‑298 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCC > 2:444431/1‑300 GTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCC > 1:645917/1‑295 ATGGGACTATACCGTGATGGGGCTTGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCTGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTC < 2:645917/300‑1 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TGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGNCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAG < 2:508357/300‑1 TGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAG < 2:17949/300‑1 TGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAG < 1:318234/300‑1 TTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAGCG < 2:486647/300‑1 TGATGGCCAATATCGAAGCGAAATATCATCTTAATGATCCGATCATGACACAGTATTTCAGCTACCTGAAACAACTGGCGCACGGTGATTTCGGTCCATCGTTTAAATATAAAGATTATTCGGTCAATGACTTGGTTGCATCCAGTTTTCCCGTTTCTGCCAAACTGGGAGCCGCAGCATTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1303032‑1303319‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAGCG > NC_000913/2514273‑2514569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |