| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,753,888 | G→C | A197G (GCG→GGG) | ydhY ← | putative 4Fe‑4S ferredoxin‑like protein YdhY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,753,888 | 0 | G | C | 99.2% | 524.3 / NA | 134 | A197G (GCG→GGG) | ydhY | putative 4Fe‑4S ferredoxin‑like protein YdhY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (56/77); minor base T (0/1); total (56/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTGATATTTACGCGAGAACTACAGGGGGCACCAGATCCAGTTAATGGGCCGGTAGCAAAGACTAATTTATTCGCTTCATCGAAAGGTTTCGTGCCTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGATTTTTTCCTTTGCAAGATTCACACAGTAATATCTTTCCACTCGATAATTTTTAACGCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCATTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGCCGTAGTACAGGCGCTACAGCCAATACAGCGTTTATGATCGACGGTAATACAGCCTTCTTTCTGCTGCCAGGTAATCGCACCAATCGGGCAGACGTTCATGCATTGCGGCTCTTTGCATTGACGGCAGGTGTCCGCGGTATAGTTGAGATCGCCATACAGGCCGCCGCCAGAGCCAACCCCGTTGT > NC_000913/1753595‑1754170 | gTGATATTTACGCGAGAACTACAGGGGGCACCAGATCCAGTTAATGGGCCGGTAGCAAAGACTAATTTATTCGCTTCATCGAAAGGTTTCGTGCCTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGATTTTTTCCTTTGCAAGATTCACACAGTAATATCTTTCCCCTCGATAATTTTTAACCCCCCTg > 1:51552/1‑300 (MQ=255) 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gTAATATCTTTCCCCTCGATAATTTTTAACCCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCATTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGCCGTAGTACAGGCGCTACCGCCAATACCGCGTTTATGATCGACGGTAATACAGCCTTCTTTCTGCTGCCAGGTAATCGCACCAATCGGGCAGACGTTCATGCATTGCGGCTCTTTGCATTGACGACAGGTGTCCGCGTTATAGTTGAGATCGCCATACAGGCGGCCGCCagcg > 2:104663/1‑298 (MQ=255) gTAATATCTTTCCACTCGATAATTTTTAACCCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCATTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGCCGTAGTACAGGCGCTACAGCCAATACAGCGTTTATGATCGACGGTAATACAGCCTTCTTTCTGCTGCCAGGTAATCGCACCAATCGGGCAGACGTTCATGCATTGCGGCTCTTTGCATTGACGGCAGGTGTCCGCGGTATAGTTGAGATCGCCATACAGGCCGCCGCCagag > 1:753182/1‑300 (MQ=255) gTAATATCTTTCCACTCGATAATTTTTAACCCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCANTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGCCGTAGTACAGGCGCTACAGCCAATACAGCGTTTATGATCGACGGTAATACAGCCTTCTTTCTGCTGCCAGGTAATCGCACCAATCGGGCAGACGTTCATGCATTGCGGCTCTTTGCANTGACGGCAGGTGTCCGCGGTATAGTTGAGATCGCCATACAGGCCGCCGCCagaa > 2:810980/1‑299 (MQ=255) | GTGATATTTACGCGAGAACTACAGGGGGCACCAGATCCAGTTAATGGGCCGGTAGCAAAGACTAATTTATTCGCTTCATCGAAAGGTTTCGTGCCTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGATTTTTTCCTTTGCAAGATTCACACAGTAATATCTTTCCACTCGATAATTTTTAACGCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCATTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGCCGTAGTACAGGCGCTACAGCCAATACAGCGTTTATGATCGACGGTAATACAGCCTTCTTTCTGCTGCCAGGTAATCGCACCAATCGGGCAGACGTTCATGCATTGCGGCTCTTTGCATTGACGGCAGGTGTCCGCGGTATAGTTGAGATCGCCATACAGGCCGCCGCCAGAGCCAACCCCGTTGT > NC_000913/1753595‑1754170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |