| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,739,696 | T→G | intergenic (+169/‑9) | malS → / → avtA | alpha‑amylase/valine‑‑pyruvate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,739,696 | 0 | T | G | 99.0% | 392.4 / NA | 104 | intergenic (+169/‑9) | malS/avtA | alpha‑amylase/valine‑‑pyruvate aminotransferase |
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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aCAGAGTTCGACAGAGATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGTTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACTGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCCGGAATGCTGCGCGAGAAgttgggt < 2:474282/300‑1 (MQ=255) gTTCGACAGAGATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCCCTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCAGGAATGCTGCGCGAGAAGTTGGGTTGGGa > 2:300803/1‑300 (MQ=255) gTTCGACAGAGATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCCGGAATGCTGCGCGAGAAGTTGGGTTGGGa > 1:142965/1‑300 (MQ=255) | AGTTCCGCGCCCGCCATCCCGCAATTGGCGCGGGCAAACAAACGACACTTTTGCTGAAGCAGGGCTACGGCTTTGTTCGTGAGCATGGCGACGATAAAGTGCTGGTCGTCTGGGCAGGGCAACAGTAACTTTTCCGGCTTCCCGTTCGTCAGTACCTCGGGAAGCCGCCAACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCCGGAATGCTGCGCGAGAAGTTGGGTTGGGA > NC_000913/3739400‑3739985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |