| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,810,385 | G→A | V14V (GTG→GTA) | ygaH → | L‑valine exporter, YgaH component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,810,385 | 0 | G | A | 99.1% | 392.5 / NA | 110 | V14V (GTG→GTA) | ygaH | L‑valine exporter, YgaH component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (45/64); total (45/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TAGGGGCATTCTCCGGCAGCGGCTTGCTGCAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATTATATAA > NC_000913/2810089‑2810679 | tAGGGGCATTCTCCGGCAGCGGCTTGCTGCAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGNGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCNATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTtggcgtagcg < 2:590080/300‑1 (MQ=255) gggCATTCTCCGGCAGCGGCTTGCTGCAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAat > 1:311193/1‑300 (MQ=255) tctcCGGCAGCGGCTTGCTGCAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGc < 1:372832/300‑1 (MQ=255) ctgcAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCt > 1:214945/1‑300 (MQ=255) 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tctTTATGGGTTGCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAGTCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTAtt < 2:173858/300‑1 (MQ=255) gCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTg < 1:560634/300‑1 (MQ=255) tCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGc < 1:514375/300‑1 (MQ=255) 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ttACTAGTTGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAAACAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCg > 2:497924/1‑300 (MQ=255) ttGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGTTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATtatat < 2:375049/300‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATtatat < 1:171194/300‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATtatat < 2:505073/300‑1 (MQ=255) ggcgtagcgAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGNCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATTATATaa < 1:581669/300‑1 (MQ=255) ggcgtagcgAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATTATATaa < 1:433504/300‑1 (MQ=255) | TAGGGGCATTCTCCGGCAGCGGCTTGCTGCAAGGTTATCCCGCCGTTGAAGCTGCATTAGGTTTTATGCTTCCGGCACTCTTTATGAGTTTCCTGCTCGCCTCTTTCCAGCGCAAACAATCTCTTTGCGTTACCGCAGCGTTAGTTGGTGCCCTTGCAGGCGTAACGCTATTTTCTATTCCCGTCGCCATTCTGGCAGGCATTGTCTGTGGCTGCCTCACTGCGTTAATCCAGGCATTCTGGCAAGGAGCGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGTGCGCTGGCCTATGGGCTCGCCTGGAAAGTGATGGCGATTATATAA > NC_000913/2810089‑2810679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |