New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 781222 | 58 (0.530) | 6 (0.070) | 5/446 | 8.2 | 10.9% | noncoding (76/76 nt) | lysY | tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | 781653 = | 55 (0.670) | intergenic (+1/‑432) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAC > NC_000913/780927‑781514 | aTCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGNCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGttt > 1:580388/1‑300 (MQ=255) cggaaGCAACGGCCCGTAGGTCAAGCGAAGCAAGTCATCCTGAACGACCAACCACCAATAACATCCGGTTCGGTAGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTTGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAAc < 1:503728/296‑1 (MQ=17) cGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGNGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACNCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAAc < 2:567202/300‑1 (MQ=255) gggCGAACGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGTTTCGTTGGAAGTAGTTTGTATTATCCAGCGCAGCCTCTGTTGATTAGCTCAGCTGTGAGAGCACCTCCCTTACAATGAGGGGTTCGGTGGTTTGCTTCTTTTATTATTCGCTAATCGGGTTGTAAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTGACGTT‑GGACTCGGGTGTGAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGcc < 1:794452/300‑1 (MQ=16) gcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCACTCGTGACGGTTGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAgg < 1:154525/300‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTCATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCCGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAGTTTTACCATC‑AAACTCAGATNTTAAGCGTGAAGGATACCGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGagngaagcg > 2:716410/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTACTGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTCTAATCAATTGGTCGCAGGCTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGTGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGagcgaagcg > 2:674769/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGagcgaagcg > 1:500841/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACCCAGATGTTAAGCATGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCAAGTAGGGCgagcggagcg > 1:764235/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCGGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGt > 2:539025/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGt > 1:699045/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGCTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCTAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAgg > 2:421264/1‑299 (MQ=255) aCCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTg > 1:443396/1‑300 (MQ=255) aCCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTCTAACATC‑ACAATCAGATGTTACGCGTGAAGGCTACCGT‑TGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCCTCCTg > 2:515763/1‑300 (MQ=17) aCCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAAAATC‑AACCTCAGAGGTGAAGTTTGAAGGGTGACGT‑TGCGCAAGAAACggaacataaggcaggtgaagtggggcatcctg > 2:744346/1‑270 (MQ=17) caccacTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACGCAGATTTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 1:217007/300‑1 (MQ=255) caccacTAATCACGTTTGGTTCGTTGTAAGTAGGTTGTAGTATCCAGCACAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGTCGGTTCGATCCCTTCATCACCCACCACTCGTGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTGAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGGTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAATGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 1:54551/300‑1 (MQ=14) gcgagatgtgtataagagacagagtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTCAAAATC‑AACCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCAGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑ccacca > 1:451644/23‑300 (MQ=14) ggtgggtgcggggggatggggttGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCNCAGCTGGGAGAACACCTCCCTTACAAGGAGGGGGGCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCNCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCt < 2:798496/279‑1 (MQ=14) acccaccactaacatagttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGCTGTTAAGCGTGAGGGGTACCGT‑TGAGCAAGCAACGGCCAGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCCTCCTGCACAAC‑CCCCCAATCt > 1:719120/22‑300 (MQ=11) agtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATTTCAAAGATTgatcccatgt > 1:483703/1‑291 (MQ=255) agtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCACCGAGt > 1:356621/1‑300 (MQ=255) 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ggTGATTAGCCCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTGACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCAACCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGTAt < 2:157467/300‑1 (MQ=255) gATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTGTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATGGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAT‑GTAACACCCGTATGGGt < 2:251323/300‑1 (MQ=255) gCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGACAACGT‑CGCGCAAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCACAGAGTAAAAA‑TCTTTAAG‑GTAACACCCGTATGGGGCGtt > 2:67534/1‑300 (MQ=255) 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cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATNGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCAACATCGCCAC‑CAGCCGCTAAACTTGTAG‑ACCACCTCTGCCTCCTCCACAGCCCTNAGAGCGAACAACCCGATTCCTCCTACACAAC‑CCCCCAATCCTCACAACTATCCCCGATTACAAC‑TCTTTCAA‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAACAATTTAAACGTGGtt > 2:602330/1‑300 (MQ=9) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTCCGCGTGACGGCTAACGT‑TGCGCCAGCACTGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCCTCCTGCAC‑ACACCACCAATCTTAACGGCTGGGACCGAGTAAAAA‑TCTCGAAG‑GTACCAACCTTACAGTTCGTTCGCTCAATCTGTCGCACAGGTTACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTTGAATCCGGCACGACCCACAGGTTTAAGGGTGGttcc > 2:114173/1‑298 (MQ=9) ttAGAGCAGTTTAATTTTAGTCAGTTGGTCGCATGTTCGAACCCTGCACGAACCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCCGATGTTAAGCGGTAAGGATAACGT‑TGCGCTAGCAACGGCCCTTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCACCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTCGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGt < 2:37365/299‑1 (MQ=38) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGt > 1:354409/1‑300 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGACTTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCTCGTGGTTCGAGCTAGGGGGGTCGTAGGGGGTGAT‑AAGATAAGTTGAAAGGGGGGTTTCG‑GTGAGGA‑GGTTTTTGTGTAACACCCGGATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTagag < 1:543905/300‑1 (MQ=9) acgtttAATCAAGTAGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑GGCGCCAGCAACGGTCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTGCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGaa < 1:119616/297‑1 (MQ=255) ctcacttGGTCGCAGGTGCGAATCCTACACAACCTACCAGTTTTAACATC‑GAACCCATATGTGAAGCGTTAAGGATAACGT‑TGCGTCGGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCAGCCTGTACGAC‑CAACCAACCTGAAAGATGGGTACCGAGTAAAAAGTCTC‑CAG‑GTAACACACGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAAc < 2:825406/295‑1 (MQ=25) cAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑GAATACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGT‑TGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGANGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGGAGGGGGCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:615736/300‑1 (MQ=25) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAACA‑TCTTTCCG‑GTCACACCCGTATGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTCTAATCAATTGGTCGCAGGCTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCAAGGTGGTTCCTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg > 1:122735/1‑300 (MQ=38) 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ATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGT‑TGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAC‑CCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAA‑TCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAC > NC_000913/780927‑781514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |