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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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gcccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTNGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGc > 1:604532/2‑300 (MQ=255) gcccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTCGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGc < 1:560768/299‑1 (MQ=255) gcccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTCGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGc > 2:239844/2‑300 (MQ=255) gcccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTAGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGCGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGc > 2:385619/2‑300 (MQ=255) gcccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTGTTAAGGTACCACGCTCCAGCGCGGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTCGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGc < 1:408027/299‑1 (MQ=255) ccTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTCGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGCAg > 2:144617/1‑300 (MQ=255) | AGATTCATCGGCACAAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCCAGGTCATTTGAATGCTTTTGATTTTTAAGGTACCGCGCTCCAGCGCTGTAGAAGCATACAAGTTCTCATTAATTTTACTTGCAGCACGAGTGAGATTGGCTTTGTCGGGACTGCTGTCGATGGCACGAAATTCGTTCAGTGGCAGGCTGGGATTCTGGCTGTTAAAGTCTTCTCGAAACTGGCTGATGGAGAGATCGAAAGTAGGGGCTCCAGCCAGCAGATAAGGCGCGGTCGTTGCCGTATCTGGTGTTTGTGCATGCGCCTCTGTTGTAACGGTTAATGCAG > NC_000913/4111584‑4112177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |