Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 2,057,687 | A→G | intergenic (+113/+340) | yeeN → / ← asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,057,687 | 0 | A | G | 99.3% | 575.5 / NA | 147 | intergenic (+113/+340) | yeeN/asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (81/65); minor base T (0/1); total (81/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
AAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGTTCTCAACAACAGAATTAGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATACCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCAATTACGCATAGTTTCCCGATAAAGACGCGATAGCGACATCCCGCATAAGGCATTTTTCTCTTTATCTTTGTACGGTACTTCATGGAACAGAGTTTTTGACCTTGCGAATCGTGATGTCTGTTGGGGAGGGACAATTTGCTCACTGAAGCGTGAGACTCGATTAAGCGCACGAAACACAGAAATCAAAAAACCCGGTCACTTTTTTACAAGGTAACCGGGTAAAAATAATTTTTATT > NC_000913/2057393‑2057981 | aaGGAACCTCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCATTGATTTCTCAACAACAGAATGAGAAATAATTGCTCAATCGGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCTTTGAAGATGACGACGATGGAAAAAAAGTTTGTCAGAACTTCGCAAACTTCGAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTGACGGCAGATTTCTTGAATCTCATATAATTCTTAGAAAAAATACAATATTCAACTCGTCAGATTGATTATACCCCCCCGTTCCCAGAGGaataa < 2:365626/300‑1 (MQ=255) 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AAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGTTCTCAACAACAGAATTAGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATACCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCAATTACGCATAGTTTCCCGATAAAGACGCGATAGCGACATCCCGCATAAGGCATTTTTCTCTTTATCTTTGTACGGTACTTCATGGAACAGAGTTTTTGACCTTGCGAATCGTGATGTCTGTTGGGGAGGGACAATTTGCTCACTGAAGCGTGAGACTCGATTAAGCGCACGAAACACAGAAATCAAAAAACCCGGTCACTTTTTTACAAGGTAACCGGGTAAAAATAATTTTTATT > NC_000913/2057393‑2057981 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |