New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4392437 | 77 (0.650) | 4 (0.050) | 4/442 | 9.3 | 6.4% | intergenic (+2/‑35) | glyV/glyX | tRNA‑Gly/tRNA‑Gly |
? | NC_000913 | 4392661 = | 60 (0.680) | intergenic (+3/‑231) | glyY/yjeV | tRNA‑Gly/uncharacterized protein YjeV | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTC > NC_000913/4392156‑4392731 | tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAANTTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAAGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 2:722077/300‑1 (MQ=255) tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGTGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 1:846255/300‑1 (MQ=255) tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 1:108111/300‑1 (MQ=255) tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 2:607996/300‑1 (MQ=255) tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAAGTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTGGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGGTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAACTACGAAAGCAAAATTAAGTAGGACGCGGGAATAGCTCAGTTGTGAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 2:52166/300‑1 (MQ=255) gTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCTTGATTTTGACGCTAAATTGAACGCCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGAGAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGcac < 2:138892/300‑1 (MQ=255) gTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGcac < 1:591007/300‑1 (MQ=255) 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gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGTCGGCGTGATTGTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACGTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 2:454563/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCTTGATTTTGACGCTAAAGTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACGTGAGATAACAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 2:827071/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 1:177006/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGCTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 1:157214/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCGAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGGTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCATGACCTTGCCAAGTTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 1:157004/300‑1 (MQ=255) gTAAGCACCGGAATCCATTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATGGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 2:19139/300‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |