New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | 15 (0.130) | 14/590 | 6.3 | 13.5% | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | = 2904080 | 96 (0.850) | intergenic (+706/+667) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTT > NC_000913/2903784‑2904375 | aaaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGNTAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATcc < 1:675608/300‑1 (MQ=255) aaaaTTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATccc < 1:186792/300‑1 (MQ=255) cAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGgcg < 1:431954/300‑1 (MQ=255) cAGGCATTAAGTCAATAGTAAAAAAATAAGAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAGATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCTGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGgcg < 1:231176/300‑1 (MQ=255) 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ggCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAtt < 1:864645/300‑1 (MQ=255) cAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCCGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGTACGcc > 2:479891/1‑300 (MQ=255) agtCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGAAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCtttt > 1:240736/1‑300 (MQ=255) gttagcgcttatgcGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTg > 1:926646/14‑300 (MQ=255) cGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATACCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTAAGCCTCTTTGCGa > 2:535160/1‑300 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTCTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGCTTGCCCGGtttt > 1:560770/1‑300 (MQ=255) | AAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTA‑TTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTT > NC_000913/2903784‑2904375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |