| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,510,238 | 0 | T | G | 96.7% | 539.9 / ‑5.9 | 151 | intergenic (+445/+452) | insO/fecE | IS911B regulator fragment/ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/5); new base G (83/63); total (83/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.70e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTT > NC_000913/4509947‑4510531 | gcCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCAACATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCAATTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGACGATATCATTGATAACAATCGATCCCTCAACTGGCCTGTATCACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAACCGCACCTACCTAAATAGTCGCAAACACACACTTTTTAGAAAAACCGCTGGTCAGAAACTGGATTAGCAACTCCGTTCCAGGGttactc > 2:166159/1‑296 (MQ=255) 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aTTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCTTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGctc < 2:435598/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTTTGCTTTGGATTTACGTTGGCTTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCACCCTCATTGGGAATGAACCAGCTCTGTGAATGTCCGCTCTTGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGCCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAANTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAGGGGTTATACAGAAATGTCCGTGAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTGGNAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 2:605972/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTTGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTTGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 2:168617/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTTGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGANCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 1:585823/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTTGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGCTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 1:108808/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGGTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 2:804471/300‑1 (MQ=255) | GCCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTT‑GGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTT > NC_000913/4509947‑4510531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |