| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,485,920 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑102/‑196) | yhfA ← / → crp | OsmC family protein YhfA/DNA‑binding transcriptional dual regulator CRP |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3485924 | 0 (0.000) | intergenic (‑106/‑196) | yhfA/crp | OsmC family protein YhfA/DNA‑binding transcriptional dual regulator CRP | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 122 (1.160) | 76/596 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3485920 = | 0 (0.000) | intergenic (‑102/‑200) | yhfA/crp | OsmC family protein YhfA/DNA‑binding transcriptional dual regulator CRP | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA‑TGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTCC > NC_000913/3185801‑3186392 | aGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCCACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACANGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGNCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGAc < 2:554922/300‑1 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cATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA‑TGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAAc < 1:667259/300‑1 (MQ=34) ttattaGCCTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCCTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGCGAACAGATGATTGA‑TGTCTTAGGGCAGGCGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTATGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTAATGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 1:153441/1‑300 (MQ=255) tattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA‑TGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAANCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTNCTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTcc < 2:600570/300‑1 (MQ=11) | AGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA‑TGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTCC > NC_000913/3185801‑3186392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |