| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1469296 = | NA (NA) | 63 (0.600) | 43/596 | 1.2 | 75.9% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1909271 = | 20 (0.190) | intergenic (+107/+37) | yobH/kdgR | uncharacterized protein YobH/DNA‑binding transcriptional repressor KdgR | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |