| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 14,775 | (ATGGTC)2→1 | coding (608‑613/1131 nt) | dnaJ → | chaperone protein DnaJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 14772 = | 13 (0.120) | 75 (0.730) | 50/580 | 0.7 | 85.9% | coding (605/1131 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ |
| ? | NC_000913 | = 14765 | 12 (0.120) | coding (598/1131 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ | |||||
GGCGGCGGACGTGGTCGTCAACGTGCGGCGCGCGGTGCTGATTTACGCTATAACATGGAGCTCACCCTCGAAGAAGCTGTACGTGGCGTGACCAAAGAGATCCGCATTCCGACTCTGGAAGAGTGTGACGTTTGCCACGGTAGCGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCTGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGTGAAGCGGGCGAGCATGGCGCACCGGCAGGCGATCTGTACGTTCAGGTTCAGGTTAAACAGCACCCGATTTTCGAGCGTGAAGGCAACAACCTGTATTGCGAAGTCCCGATCAACTTCGCTATGGCGGCGCTGGGTGGCGAAATCGAAGTACCGACCCTTGATGGTCGCGTCAAACTGAAAGTGCCTGGCGAAACCCAGACCGGTAAGC > NC_000913/14474‑15071 | ggcggcGGACGTGGTCGGCAACGTGCGGCGCGCGGTGCTGATTTACGCTATAACATGGAGCTCACCCTCGAAGAAGCTGTACGTGGCGTGACCAAAGAGATCCGCATTCCGACTCTGGAAGAGTGTGACGTTTGCCACGGTAGCGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCTGATCAAAGATCCGTGCAACAAATgtcatggt < 1:513668/300‑1 (MQ=255) cggacgtggtcgtcaacgtgcggcgcgcggtgctgatttacgctataacatggagctcaccctcgaagaagctgtacgtggcgtgaccaaagagatccgcattccgactctggaagagtgtgacgtttgccacggtagcggtgcaaaaccaggtacacagccgcagacttgtccgacctgtcatggttctggtcaggtgcagatgcgccagggattcttcgctgtacagcagacctgtccacactgtcagggccgcggtacgctgatcaaagatccgtgcaacaaatGTCATGGTCgtgt > 1:460641‑M1/288‑300 (MQ=255) gacgtggtcgtcaacgtgcggcgcgcggtgctgatttacgctataacatggagctcaccctcgaagaagctgtacgtggcgtgaccaaagaaatccgcattccgactctggaagagtgtgacgtttgccacggtagcggtgcaaaaccaggtacacagccgcagacttgtccgacctgtcatggttctggtcaggtgcagatgcgccagggattcttcgctgtacagcagacctgtccacactgtcagggccgcggtacgctgatcaaagatccgtgcaacaaatGTCATGGTTGTGTTg < 2:166135‑M1/15‑1 (MQ=255) gtggtcgtcaacgtgcggcgcgcggtgctgatttacgctataacatggagctcaccctcgaagaagctgtacgtggcgtgaccaaagagatccgcattccgactctggaagagtgtgacgtttgccacggtagcggtgcaaaaccaggtacacagccgcagacttgtncgacctgtcatggttctggtcgggtgcagatgcgccagggattcttcgctgtacagcagacctgtccacactgtcagggccgcggtacgctgatcaaagatccgtgcaacaaatGTCATGGTcgtgttaagc < 2:187884‑M1/18‑5 (MQ=255) 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GGCGGCGGACGTGGTCGTCAACGTGCGGCGCGCGGTGCTGATTTACGCTATAACATGGAGCTCACCCTCGAAGAAGCTGTACGTGGCGTGACCAAAGAGATCCGCATTCCGACTCTGGAAGAGTGTGACGTTTGCCACGGTAGCGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCTGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGTGAAGCGGGCGAGCATGGCGCACCGGCAGGCGATCTGTACGTTCAGGTTCAGGTTAAACAGCACCCGATTTTCGAGCGTGAAGGCAACAACCTGTATTGCGAAGTCCCGATCAACTTCGCTATGGCGGCGCTGGGTGGCGAAATCGAAGTACCGACCCTTGATGGTCGCGTCAAACTGAAAGTGCCTGGCGAAACCCAGACCGGTAAGC > NC_000913/14474‑15071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |