| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1909272 | 14 (0.130) | intergenic (+108/+36) | yobH/kdgR | uncharacterized protein YobH/DNA‑binding transcriptional repressor KdgR | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
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ACAGATTGAATCTATAGGTTCTTTATTGAGCATGATAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCATTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATC < 2:216284/300‑1 CAGATTGAATCTACAGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCC < 1:401041/300‑1 GATTGAATCTACAGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCCGC > 2:755703/1‑300 ATTGAATCTACAGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCCGCT > 1:747619/1‑300 ATCTACAGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCCGCTGAGTA > 1:52360/1‑300 ATCTACAGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTAATCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCCGCTGAGTA > 1:743527/1‑300 AAATCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1470219‑1470516‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaGGTTCTTTATTTAGCATGAGAAAAATAAAGTTGAAGGTGGCGTTATATTAAACGCGCTTGCTATAAGAGTATTTTACTCAGGAGTGAGAATCTGGTTATTTATTGCCCTTAACCATTATCGACCACGATATTGCTTTTGCGTAACAGCGGGCAATCTGTTATCCCCAAAAAACCACTTTTAGTGTGCAAGTATTGTACCGTGCTGGTGCCTCTGGCAGTCAGATAGGTACATTGCAAACCTAATCCTGCGGCATTCTCTTTGCTTCCAATCAAAACGCCATATCCGCTGAGTA < NC_000913/1909272‑1908980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |