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agtaagttggcagcatcaccCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCctgatctga < 1:276552‑M1/280‑1 (MQ=255) cAGCGTTAATAGTACCAGTTGTGAggtaatgactccaacttagtgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgt < 2:75821‑M1/300‑277 (MQ=255) tggcagcatcaccCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAAt > 1:613340‑M1/14‑300 (MQ=255) agcatcaccCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCa > 1:240897‑M1/10‑300 (MQ=255) gcatcaccCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGAATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCat < 2:443168‑M1/292‑1 (MQ=255) atcaccCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCatat < 1:599235‑M1/294‑1 (MQ=255) 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ATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGTCACCTTTTTGCCAATCTTCAGCGTTAATAGTACCAGTGTTGATTGCTTGTATAAGGAGATCAAGGTAAAGACCTAAAGCATCATTTTGTTTATGGTTCCACAGCTGCGGCTTGCCTTCTTCCTGCACATCTGCCATCACGGGGGAGTTGCTGTCAAATCGGATATGCACAGCATTCATTTGCACGGGAATTCCATCCAGTCGTTTTGGGTTGCTAATGACGTCCTGCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCATATAGCCC > NC_000913/2997842‑2998439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |