| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,406,557 | (TGCGGCAGC)1→2 | coding (85/939 nt) | lrhA ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2406541 = | 3 (0.030) | 86 (0.950) | 62/582 | 0.2 | 98.3% | coding (101/939 nt) | lrhA | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
| ? | NC_000913 | = 2406549 | 0 (0.000) | coding (93/939 nt) | lrhA | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA | |||||
GAAGATATATTCTGTGATCTACTTCAGGCATTATAACGGAACAATGTGAGTCGCTTTTTTAGTGCAACTCATATGCATTTTTACTTTCGTCCGGGTTCCGGATGAAACTGCCAGGGAGGCACATTACAAATGGAATTGCTTGTTTGTGTGTGCACAGCATTAACCAGCTCAGTATGAGCCGCCAGTAAGTGATAATATATGATAAGTGCAAATCGTCCGATAATTAACCTCGACCTCGATCTGCTGAGAACATTTGTTGCTGTTGCCGATCTGAACACTTTTGCTGCCGCAGCTGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2406839‑2406541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctgccgcAGCTGCCGCTGTGTGTCGTACTCAGTCCGCCGTAAGTCAGCAAATGCAGCGTCTGGAACAACTCGTTGGGAAAGAACTGTTCGCTCGTCACGGTCGCAACAAACTGTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTT < NC_000913/2406549‑2406270 GAAGATATATTCTGTGATCTACTTCAGGCATTATAACGGAACAATGTGAGTCGCTTTTTTAGTGCAACTCATATGCATTTTTACTTTCGTCCGGGTTCCGGATGAAACTGCCAGGGAGGCACATTACAAATGGAATTGCTTGTTTGTGTGTGCACAGCATTAACCAGCTCAGTATGAGCCGCCAGTAAGTGATAATATATGATAAGTGCAAATCGTCCGATAATTAACCTCGACCTCGATCTGCTGAGAACATTTGTTGCTGTTGCCGATCTGAACACTTTTGCTGCCGCAGCTGCCGCA > 1:428390/1‑300 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TCTGAACACTTTTGCTGCCGCAGCTGCCGCAGCTGCCGCTGTGTGTAGTACTCAGTCCGCCGTAAGTCAGCAAATGCAGCGTCTGGAACAACTCGTTGGGAAAGAACTGTTCGCTCGTCACGGTAGCAACAAACTGTTAACTGAACATGGGATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGCTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACTTTTCCTGTTAAATCGCGT > 2:222112/1‑300 ACACTTTTGCTGCCGCAACTGCCACAGCTGCCACTATGTGTCGTACTCAGTCCGCCGTAAGTCAGCAAATGCAGCGTCTGGAACAACTCGTTGGGAAAGAGCTGTTCGCTCGTCGCGGTCGCAACAAACTGTTAACTGAACATGGCATTCAACTCCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGATTCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTT < 1:259656/300‑1 TTTGCTGCCGCAGCTGCCGTAGTTGCCGCTGTGTGTCGTACTCAGTCCGCCGTAAGTCAGCAAATGCAGCGTCTGGAACAACTCGTTGGGAAAGAACTGTTCGCTCGTCACGGTCGCAACAAACTGTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTT < 1:158726/300‑1 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NC_000913/2406839‑2406541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctgccgcAGCTGCCGCTGTGTGTCGTACTCAGTCCGCCGTAAGTCAGCAAATGCAGCGTCTGGAACAACTCGTTGGGAAAGAACTGTTCGCTCGTCACGGTCGCAACAAACTGTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTT < NC_000913/2406549‑2406270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |