Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,719,429 | G→A | intergenic (‑385/‑49) | yiaF ← / → yiaG | DUF3053 domain‑containing protein YiaF/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,719,429 | 0 | G | A | 99.3% | 529.0 / ‑4.4 | 143 | intergenic (‑385/‑49) | yiaF/yiaG | DUF3053 domain‑containing protein YiaF/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
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tgtCTGCTTTTCCCGACTATTCTTAATAAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAg < 1:692188/300‑1 (MQ=255) aTTCTTAATAAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGAt > 1:693700/1‑300 (MQ=255) ttCTTAATAAGCTTCGATGCAATGCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATGACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATg < 2:395323/300‑1 (MQ=255) | TTTCTACGTAATCTTCCTGGTAAAATCATGGAGAAAATGAAACAAGGTTAATTTGTTGTTTCATTGTTAAAAAATGATAGTGCCGTTGCCTTTTTTGTAGCCAGAGATTTACGCCTTCGCAGAAGGTTAGATTTTCGAAATCTTTACAAAACAGGAGTGGTAAGAGATATATCGGCATTTATCAGATCGTTAGGTGGCTATAAGTCACGCTAAATGACAGGCTGAATCGAATCATAGCCAGAGCATGCCCTGACTTCACCCCGCTGTGTCTGCTTTTCCCGACTATTCTTAATGAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCG > NC_000913/3719136‑3719722 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |