| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,436,782 | IS2 (–) +5 bp | coding (265‑269/1377 nt) | trkA → | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 75 (0.740) | 60/598 | 0.4 | 79.5% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3436786 | 19 (0.190) | coding (269/1377 nt) | trkA | NAD‑binding component of Trk potassium transporters | |||||
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AAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATACTCGTGTGGCAGCAAT > NC_000913/3436488‑3437080 | acaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgaggtagaccgtcatccccggttcaaagctcngctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTTTTc < 2:190034‑M2/6‑1 (MQ=255) 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atatGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttaggttc < 1:661331‑M2/300‑267 (MQ=255) atGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCca < 1:105762/300‑1 (MQ=255) ctgccAGGTAGCCTACTCACTTTTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgccccgccgtgttcttcggttcaagtcccaac < 2:515855‑M2/300‑277 (MQ=255) tcaggtggccagtctaCTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATAc < 1:261083‑M2/284‑1 (MQ=255) tcagggggccagtctaCTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATAc < 1:261539‑M2/284‑1 (MQ=255) cagtgggccagtctaCTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATACt < 2:250617‑M2/285‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCTACTCACTTTTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattncgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtccaaacatcc < 2:611189‑M2/300‑281 (MQ=255) gtctaCTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATACTCGTGTGgcag > 2:457917‑M2/6‑300 (MQ=255) aCTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGcctgtctcttatacacatctcgcag < 1:72381/300‑24 (MQ=255) | AAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCGAACATATGCCACATATCGATACTCGTGTGGCAGCAAT > NC_000913/3436488‑3437080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |