New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1107753 = | 51 (0.510) | coding (1399/1422 nt) | clsC | cardiolipin synthase C |
AAGTAGTACGTTACACGATCGCGGCATAACCGGTAATTCCGGAGCCAGCCTGCATGCTAAAACCTTTAGCATCGATGGTAAAACGGTGTTTATCGGCTCTTTCAATTTCGATCCGCGTTCAACATTGCTCAATACTGAAATGGGCTTCGTGATAGAGAGCGAAACGCTGGCACAGTTAATTGATAAACGCTTTATTCAGAGCCAGTATGATGCGGCCTGGCAGCTCCGTCTGGACAGGTGGGGACGGATCAACTGGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1107407‑1107699 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CAACTGGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGA > 1:67621/1‑300 ACTGGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTCACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGNATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACNGCGATG > 2:673193/1‑300 ACTGGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGCGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGTGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACCAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGCTGTGCGGTGTAGTGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGCAACAGATAGATAAACAGCGAgg > 2:274360/1‑298 GGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGATGCGT > 1:356912/1‑300 GGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAANATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGATGCGT > 1:601743/1‑300 GTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAACAACTTCAGTAACGGAATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCAACAGAGAAAACCAAGCCAGTGTGAGGTGATGTTCGATGTAATGTATGCGCCGAAAGACAGCGCTACCGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGATACGTTA > 2:88008/1‑300 GAAAGAGATTATTCTCAAAATTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGATGCGTTAACAAAATAAGTCACCCG > 1:701509/1‑300 AAGTAGTACGTTACACGATCGCGGCATAACCGGTAATTCCGGAGCCAGCCTGCATGCTAAAACCTTTAGCATCGATGGTAAAACGGTGTTTATCGGCTCTTTCAATTTCGATCCGCGTTCAACATTGCTCAATACTGAAATGGGCTTCGTGATAGAGAGCGAAACGCTGGCACAGTTAATTGATAAACGCTTTATTCAGAGCCAGTATGATGCGGCCTGGCAGCTCCGTCTGGACAGGTGGGGACGGATCAACTGGGTTGATCGTCATGCAAAGAAAGAGATTATTCTCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1107407‑1107699 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aTTGCCCGTGGAATGGTTATTGTAAATGTGGCTTAACGGGCTGGTGCTTTATCGTTCTCACGCTTAACAACCGGTTTACCAGAGAACAAAAACTTCAGTAACGGGATGCGCAAATGAATTTCATACAGAATTATCGCAATCCCTACTACAAATATCAGGCCACAGAGAAAACCAAGCCAGTTGGAGGTGATGTGCGGTGTAATGTATGCGCCGAAAAACAGCGTTAACGGGTGGTGAACCAGATAGATAAACAGCGATGCGTTAACAAAATAAGTCACCCG > NC_000913/1107753‑1108032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |