| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,640,785 | C→T | intergenic (+14/‑157) | ytjE → / → yjtD | protein YtjE/putative tRNA/rRNA methyltransferase YjtD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,640,785 | 0 | C | T | 99.4% | 577.8 / NA | 167 | intergenic (+14/‑157) | ytjE/yjtD | protein YtjE/putative tRNA/rRNA methyltransferase YjtD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (75/91); total (75/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
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ACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACTAATAAACGTGGTGAATCCAATTGTCGAGATTTA‑TTTTTTATAAAATTATCCTAAGTAAACAGAAGGATATGTAGCATTTTTTAACAACTCAACCGTTAGTACAGTCAGGAAATAGTTTAGCCTTTTTTAAGCTAAGTAAAGGGCTTTTTCTGCGACTTACGTTAAGAATTTGTAAATTCGCACCGCGTAATAAGTTGACAGTGATCACCCGGTTCGCGGTTATTTGATCAAGAAGAGTGGCAATATGCGTATAACGATTATTCTGGTCGCACCCGCCAGAGCAGAAAATATTGGGGCAGCGGCGCGGGCAATGAAAACGATGGGGTTTAGCGATCTGCGGATTGTCGATAGTCAGGCACACCTGGAGCCAGCCACCCGCTG > NC_000913/4640490‑4641078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |