Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,390,331 | C→T | Q10Q (CAG→CAA) | psd ← | phosphatidylserine decarboxylase proenzyme |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,390,331 | 0 | C | T | 98.6% | 470.2 / NA | 139 | Q10Q (CAG→CAA) | psd | phosphatidylserine decarboxylase proenzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (66/70); minor base G (1/1); total (68/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CCTTTGGCTTGCAGGATTTTATCTTCTTCGATTTTACCCAACTGGCTGATAACGCCATCGGCAGGCATGACCAGTACATTCGGATCGGTATCGATTGGGCGTACTTCGTCACGCAGCGGACGGACAAAGAATTCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTGTAGTATTTAACGAACAGATCGATAACCAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGATTTTCCCTTCCTCAACCGCTTCCCGGATAGCGCAGCCCGGATCGGTATCGTGTTTGCAATCGCGATATTTACACAGA > NC_000913/4390035‑4390625 | ccTTTGGCTTGCAGGATTTTATCTTCTTCGATTTTACCCAACTGGCTGATAACGCCATCGGCAGGCATGACCAGTACATTCGGATCGGTATCGATTGGGCGTACTTCGTCACGCAGCGGACGGACAAAGAATTCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTACGCCTATTTCATGTCGAACTTGTAGTATTTAACGAACAGATCGATAAGCAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTNCTTGCGCCCCAACACGCAAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTATTGt > 2:640217/1‑300 (MQ=255) 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gAATGTATTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGATTTTCCCTTCCTCAACCGCTNCCCGGATAGCGCAGACCGGATCGGTATCGTGTTTGCAATCGCGATATNTAcaca > 2:707878/1‑300 (MQ=255) aTGTATTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGTCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGATTTTCCCTTCCTCAACCGCTTCCCGGATAGCGCAGCCCGGATCGGTATCGTGTTTGCAATCGCGATATTTAAACAGa > 2:483732/1‑300 (MQ=255) aTGTATTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGATTTTCCCTTCCTCAACCGCTTCCCGGATAGCGCAGCCCGGATCGGTATCGTGTTTGCAATCGCGATATTTACACAGa > 2:496560/1‑300 (MQ=255) | CCTTTGGCTTGCAGGATTTTATCTTCTTCGATTTTACCCAACTGGCTGATAACGCCATCGGCAGGCATGACCAGTACATTCGGATCGGTATCGATTGGGCGTACTTCGTCACGCAGCGGACGGACAAAGAATTCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTGTAGTATTTAACGAACAGATCGATAACCAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGATTTTCCCTTCCTCAACCGCTTCCCGGATAGCGCAGCCCGGATCGGTATCGTGTTTGCAATCGCGATATTTACACAGA > NC_000913/4390035‑4390625 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |