Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,344,501 | G→A | G378D (GGC→GAC) | melB → | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,344,501 | 0 | G | A | 99.2% | 449.4 / NA | 133 | G378D (GGC→GAC) | melB | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (65/67); total (66/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGT > NC_000913/4344206‑4344793 | cTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTNTCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCNGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGGTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGt > 2:693264/1‑300 (MQ=255) 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aTGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGcc < 1:352923/300‑1 (MQ=255) gtgAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGt > 1:465816/1‑300 (MQ=255) gtgAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGACTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGGTCCAGATCCATCTGTTGGATAAATATCGAAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTTCGGTCGGTGCAGTGAGTGATTTGAAAGCCTGACGt > 1:84362/1‑300 (MQ=255) | CTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGT > NC_000913/4344206‑4344793 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |