| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,275,204 | C→T | intergenic (‑163/‑267) | yjcB ← / → pdeC | uncharacterized protein YjcB/c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,275,204 | 0 | C | T | 99.1% | 371.8 / NA | 108 | intergenic (‑163/‑267) | yjcB/pdeC | uncharacterized protein YjcB/c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (59/48); minor base G (0/1); total (59/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTGCTGATCACCGCAAGCCCGACATAATCAGACCGACGAAAACGGATGTTGAGTGTGCTGGCCAGAAACATCATTACGGCACTAAGAAGTTGCCAGCGAAGAAGAACCACGCCAGTGGTGAGGGTAGCCATCAAACAATTCCTCTGAAAAGAGCCGATGCCCTGGACAGCGCGGCGTTGTTCACGGGAGGCGTGGTACACTCTGGCTATCGCGGGGCTTGCAGAACACAAAAATGAAACACTCTGTTTGTTTCATTAATTTTGTGAACTATATCACAATTGATTGTTTGTTAGCCATATTAGGCCGTGACTTTTATTGCTGTACAGATTATGTGGTTTTTCAGTGGCATTAAGGGCATATCTTCCCGCCGCCTCTGCATTCCTGTAGGAAATTAATTTTGAATATCAATGAATTATTTTCATCCAGGTGACGATTAGAAAGGTATCAATTTCAAATCAGGCAAAAGTGCTATTTATACCGTAAGATTTATCTAAAGACGTCGGTACCCAGGGTTTTCACCTTGCAATGGCCGGGTATAAACAGGCAGGAAATTGATAGCAATGAGTCATCGTGCACGACACCAATT > NC_000913/4274911‑4275496 | ctgctgATCACCGCAAGCCCGACATAATCAGACCGACGAAAACGGATGTTGAGTGTGCTGGCCAGAAACATCATTACGGCACTAAGAAGTTGCCAGCGAAGAAGAACCACGCCAGTGGTGAGGGTAGCCATCAAACAATTCCTCTGAAAAGAGCCGATGCCCTGGACAGCGCGGCGTTGTTCACGGGAGGCGTGGTACACTCTGGCTATCGCGGGGCTTGCAGAACACAAAAATGAAACACTCTGTTTGTTTCATTAATTTTGTGAACTATATCACAATTGATTGTTTGTTAGTCATAtt > 1:290479/1‑300 (MQ=255) 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CTGCTGATCACCGCAAGCCCGACATAATCAGACCGACGAAAACGGATGTTGAGTGTGCTGGCCAGAAACATCATTACGGCACTAAGAAGTTGCCAGCGAAGAAGAACCACGCCAGTGGTGAGGGTAGCCATCAAACAATTCCTCTGAAAAGAGCCGATGCCCTGGACAGCGCGGCGTTGTTCACGGGAGGCGTGGTACACTCTGGCTATCGCGGGGCTTGCAGAACACAAAAATGAAACACTCTGTTTGTTTCATTAATTTTGTGAACTATATCACAATTGATTGTTTGTTAGCCATATTAGGCCGTGACTTTTATTGCTGTACAGATTATGTGGTTTTTCAGTGGCATTAAGGGCATATCTTCCCGCCGCCTCTGCATTCCTGTAGGAAATTAATTTTGAATATCAATGAATTATTTTCATCCAGGTGACGATTAGAAAGGTATCAATTTCAAATCAGGCAAAAGTGCTATTTATACCGTAAGATTTATCTAAAGACGTCGGTACCCAGGGTTTTCACCTTGCAATGGCCGGGTATAAACAGGCAGGAAATTGATAGCAATGAGTCATCGTGCACGACACCAATT > NC_000913/4274911‑4275496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |