| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,647,428 | C→T | A377V (GCG→GTG) | gor → | glutathione reductase (NADPH) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,647,428 | 0 | C | T | 99.0% | 326.5 / NA | 95 | A377V (GCG→GTG) | gor | glutathione reductase (NADPH) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (49/45); minor base G (0/1); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACGAAAAAGGCTATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTG > NC_000913/3647136‑3647719 | aaCGAAAAATGCTATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACTCGGTGTGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGTTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGtat < 2:100686/300‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |