| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 582,597 | C→T | intergenic (+500/‑278) | tfaD → / → tfaX | putative tail fiber assembly protein TfaD/protein TfaX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 582,597 | 0 | C | T | 98.8% | 541.5 / NA | 161 | intergenic (+500/‑278) | tfaD/tfaX | putative tail fiber assembly protein TfaD/protein TfaX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base T (84/75); total (84/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAG > NC_000913/582301‑582891 | gTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCAGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGattac > 1:169940/1‑300 (MQ=255) 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tAAAGATATAAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTNCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCg < 1:616211/300‑1 (MQ=255) tatCAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCAt > 2:66268/1‑300 (MQ=255) tCAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAg < 1:543274/300‑1 (MQ=255) | GTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAG > NC_000913/582301‑582891 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |