Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 17,231 | T→A | intergenic (+221/‑258) | sokC → / → nhaA | small regulatory RNA antitoxin SokC/Na(+):H(+) antiporter NhaA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 17,231 | 0 | T | A | 99.2% | 452.5 / ‑2.9 | 131 | intergenic (+221/‑258) | sokC/nhaA | small regulatory RNA antitoxin SokC/Na(+):H(+) antiporter NhaA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (71/59); minor base . (1/0); total (72/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAACA‑AGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTAGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AA‑CGCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATAGCTCGTAAAAAACGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATAAAAAGTGAAACATCTGCATCGATTCTTTAGCAG > NC_000913/16942‑17517 | ctctACATGTGTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGGA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACACATCA‑CGCCGACTGa > 2:32685/1‑300 (MQ=255) ctctACATGTGTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGa > 2:667881/1‑300 (MQ=255) ctACATGTGTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTACTTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGaca > 1:143918/1‑300 (MQ=255) ctACATGTGTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCAATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGaca > 1:120188/1‑300 (MQ=255) cATGTGTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTNATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTNTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTACCA‑AATAACGCCGACTGacaaga > 2:615136/1‑298 (MQ=255) tgtgTTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGaaa < 1:38381/300‑1 (MQ=255) gtgtTCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAaat > 1:484964/1‑300 (MQ=255) tCAGCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAaattaat < 1:328088/300‑1 (MQ=255) gCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCATGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTATTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAattat > 2:12099/1‑300 (MQ=255) gCATATAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCAATCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAattat > 1:467706/1‑300 (MQ=255) atatAGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCAGACTGACAAGAAATTAAttatta > 2:323799/1‑300 (MQ=255) tataGGGGGCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTAc < 2:830619/300‑1 (MQ=255) ggCCTCGGGTTGATAGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTACCCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCt > 1:344046/1‑300 (MQ=255) gTAACATATCACTCGGGGCTTTTATCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGCTAG‑CCTAAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCAGAACGACAAGGGATTAATTATTAATTTTACTAATTAATccataaga > 2:77528/1‑294 (MQ=255) gTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTNTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAga > 1:608147/1‑299 (MQ=255) aaTATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTTAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATc < 1:516000/300‑1 (MQ=255) aaTATCACTCGGGGCTTCTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTTAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATc < 1:197202/300‑1 (MQ=255) atCACTCTGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTc < 2:312021/300‑1 (MQ=255) ggCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGc < 1:313581/300‑1 (MQ=255) gCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTNTTGTGGCGTAATTTTTTCATGATTTANTTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAGTCCTCAACTTAAGCt > 2:580309/1‑300 (MQ=255) ttCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTAAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTATTTATCGCAATCATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTCTACTAATTAATCCCTCAGAAATCCTAACATTAAGCTGTGa > 2:391299/1‑300 (MQ=255) tATCTGCCATTCAGCTAATGCCTTAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAANTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCNTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATc < 2:635516/300‑1 (MQ=255) gggctcgtagatgtgtataagagacaggCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTGTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTAGTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCt < 1:490238/279‑1 (MQ=255) gTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTa > 1:717088/1‑300 (MQ=255) cAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACNAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCNCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAggg < 2:620141/300‑1 (MQ=255) cAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAggg < 1:690657/300‑1 (MQ=255) cAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAggg < 2:840082/300‑1 (MQ=255) cAGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCGCAATCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATCGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCGAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAAGTAATTATTACTGGTCCGAAGTAATCCCGCAGAAATCCTTACCTTGAGATACGATTagcggggggtaggg < 1:44426/300‑14 (MQ=255) cAGCTAATGCCGGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAggg < 1:189130/300‑1 (MQ=255) aGCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGt < 1:786754/300‑1 (MQ=255) gCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTc > 1:70789/1‑300 (MQ=255) gCTAATGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTc > 2:13215/1‑300 (MQ=255) aTGCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTc < 1:422438/300‑1 (MQ=255) gCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGt > 1:273817/1‑300 (MQ=255) gCCTGAGACAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAACTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGt > 2:41218/1‑300 (MQ=255) tagacagatAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCACTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgc < 1:55188/299‑1 (MQ=255) gagaCAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGGCAAGAAATTAATTATTACTTTTCATAATTAATCCATAAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgc > 2:136987/1‑300 (MQ=255) gagaCAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTACTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgc < 1:55238/300‑1 (MQ=255) gagaCAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTAGCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgc < 2:449890/300‑1 (MQ=255) gagaCAGATAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTACTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGACTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTTTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATAATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgc < 2:268264/300‑1 (MQ=255) cagatag‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCtt > 1:162087/1‑300 (MQ=255) agatag‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAGGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTa > 2:742713/5‑300 (MQ=255) agatag‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTa > 1:11823/5‑300 (MQ=255) ag‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGc < 2:849669/300‑1 (MQ=255) g‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCCCCTTAAGCTATGATTCTCTGGGCtctgtctcttatacacatctcgcagggg > 2:483454/1‑273 (MQ=255) g‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGcc > 1:254232/1‑300 (MQ=255) g‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCAATCGTGAGCGCTTACAGcc > 1:261223/1‑300 (MQ=255) g‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTAAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGca > 2:402789/1‑299 (MQ=255) g‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTAGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCGCTCGTGAGCGCTTACAGcc > 1:205958/1‑300 (MQ=255) cTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGt > 1:232352/1‑300 (MQ=255) cTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGAATGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGt > 2:142783/1‑300 (MQ=255) tCAAGCACCCGACGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGAAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGANTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCCGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTc > 2:763026/1‑300 (MQ=255) gccgcTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCaa‑a‑aaactca > 1:290018/1‑295 (MQ=255) ccgcTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCaa‑a‑aaactcat > 1:79542/1‑294 (MQ=255) cTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAGTATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGTGCTTACAGCAGTCaa‑a‑aaactcatcta > 2:75963/1‑291 (MQ=255) cTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCCA‑A‑AA‑cctcatcta > 2:468156/1‑292 (MQ=255) cTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTCGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGANTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCAGTCAA‑A‑AAACNCAtctc > 2:722658/1‑300 (MQ=255) attatATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AA‑cctcatctaac > 2:366973/1‑290 (MQ=255) attatATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATNAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCAc > 1:623491/1‑300 (MQ=255) atatCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGc < 1:393241/300‑1 (MQ=255) atCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTg < 1:62501/300‑1 (MQ=255) tCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTACTCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATCTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGCAATATTGTCCTCACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTAACTCGTGAGCGCTTAAAGCCGTCAA‑A‑AAACTCCTCTCACCGCTGa > 1:415748/1‑300 (MQ=255) gCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATg < 2:391664/300‑1 (MQ=255) gCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACAGCTGATg > 2:511097/1‑300 (MQ=255) gCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTACTAATTAATCCCTCAGAACTCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAACA‑AA‑CTCAtctaaacgatgatg > 2:470886/1‑289 (MQ=255) ctctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTCTCTGGGCTTAGGGTAACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AGAA‑CTAATCTCACCGCTGATAgcg > 2:363577/1‑300 (MQ=255) ctctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGACTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGgcg > 1:743199/1‑300 (MQ=255) ctgcgagatgtgtataagagacagATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGgcgc > 1:172486/24‑300 (MQ=255) ctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCTCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTCTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCa > 1:115161/1‑300 (MQ=255) ctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGCAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTACTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTAACCGCTGATGGCGCa > 2:113739/1‑300 (MQ=255) ctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCa > 1:178009/1‑300 (MQ=255) ctTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTAACCGCTGATGGCGCa > 2:560171/1‑300 (MQ=255) tctGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAAt < 1:502762/298‑1 (MQ=255) tctGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTGTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCACCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAAt < 1:78573/298‑1 (MQ=255) gTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGNAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAAtgga > 2:770459/1‑297 (MQ=255) ttCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTAAACGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTaaaaaa > 2:558971/1‑300 (MQ=255) ttCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTACTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTAACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTaaaaaa > 2:83522/1‑300 (MQ=255) ccTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAgtta > 1:374040/1‑300 (MQ=255) tccttgCA‑TTTTTGGGGCGTAATTTTTTAAGGAGTTAATTATTGAACTGTAATTTATCTCTTTATCCCAATGATTGACGACAAGCTGGATTAGTTTTTAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAACTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTacac < 1:234352/295‑1 (MQ=255) gCCTCGCAGTTTTTG‑GGCGTAATTTGTGAATGATTTAAGTATTTAACTTTAATTTGTCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTacac < 2:411214/300‑1 (MQ=255) gCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTacac < 2:522346/300‑1 (MQ=255) gCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCACCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTacac < 2:66359/300‑1 (MQ=255) gCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATGTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTacac < 1:216588/300‑1 (MQ=255) tttttGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACN‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAACTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCt < 2:760562/300‑1 (MQ=255) tttttGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCt < 2:499960/300‑1 (MQ=255) tgtgGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGAtt < 2:168056/300‑1 (MQ=255) aTGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCANCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGNGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGc < 2:580723/300‑1 (MQ=255) tGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCg > 1:328720/1‑300 (MQ=255) gATTTAATTATTTAACTTTGATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGTGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCgg < 2:341405/300‑1 (MQ=255) ttAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGt < 1:186544/300‑1 (MQ=255) tattTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAAt < 2:379396/300‑1 (MQ=255) tattTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAAt < 1:675504/300‑1 (MQ=255) ctctTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTc < 1:217073/300‑1 (MQ=255) ctctTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTc < 2:11815/300‑1 (MQ=255) taTCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGTAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCAccgg < 1:681806/299‑3 (MQ=255) attattGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga > 1:716977/1‑300 (MQ=255) acgacAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGTGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATaaaa < 2:18287/300‑1 (MQ=255) gATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATAAAAAGTGAAACATc < 2:470127/300‑1 (MQ=255) gAAATATTGTCCTAACA‑AATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTGGGCTTNGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCATCAA‑A‑AAACTCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATAAAAAGTGAAACATCTGCATCGAtt < 2:752946/300‑1 (MQ=255) cccgaaCA‑AGTAACGCCGACGGACAAGAAATGAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCATAAATCCTCACCTTAAGCTATGGTGATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACGGCCGTCAA‑A‑AAACTCATCTCACTGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAGGACGGGTTGGTCCGACACTATAATCTGAGTGTAACGATGAGTTGGGCGGGGTAAAATAGGGAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATGAAAAGTGAAACATCTGCATCGATTCTTTAGCAg < 2:265037/296‑1 (MQ=255) | CTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAG‑CCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCA‑TTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAACA‑AGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCTCACCTTAAGCTATGATTATCTAGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑A‑AA‑CGCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATAGCTCGTAAAAAACGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGAAATAAAAAGTGAAACATCTGCATCGATTCTTTAGCAG > NC_000913/16942‑17517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |